RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 RNF150Q9ULK6 438 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 BRCA2P51587 3418 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CACNA1HO95180 2353 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 M0R143 59 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 AP4M1O00189 453 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TCAPO15273 167 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 CD14P08571 375 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SELEP16581 610 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 Q499Y3 187 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TEAD3Q99594 435 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.86□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GNG13Q9P2W3 67 aa6.86□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TBPP20226 339 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ABCD3P28288 659 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 AKR1C2P52895 323 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CAV3P56539 151 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SYS1Q8N2H4 156 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SLAMF9Q96A28 289 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 H7BYZ3 331 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PHOX2AO14813 284 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CD80P33681 288 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RFC3P40938 356 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MLF1P58340 268 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 VASNQ6EMK4 673 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OXGR1Q96P68 337 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 TMEM218A2RU14 115 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SOCS6O14544 535 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 SPNP16150 400 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PSMB6P28072 239 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OPRM1P35372 400 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 GHSRQ92847 366 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 UPRTQ96BW1 309 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TMEM68Q96MH6 324 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 INTS14Q96SY0 518 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MMP26Q9NRE1 261 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TRANK1O15050 2925 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR5H14A6NHG9 310 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LIMS3P0CW19 117 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LIMS4P0CW20 117 aa6.85□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SPINK2P20155 84 aa6.85□□□□□ -1.31
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