RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LTBP1Q14766 1721 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNFRSF11BO00300 401 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLPP3O14495 311 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD5LO43866 347 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NQO2P16083 231 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ELK1P19419 428 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRLHRP49683 370 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRISP3P54108 245 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAP1AP62834 184 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TPM4P67936 248 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C2orf80Q0P641 193 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR4D1Q15615 310 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CALHM1Q8IU99 346 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NELFCDQ8IXH7 590 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q8N976 141 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GTF2H4Q92759 462 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTX4Q96A99 478 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2A5Q96R48 311 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VAT1Q99536 393 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CTRCQ99895 268 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 COA1Q9GZY4 146 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TFR2Q9UP52 801 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ASTN1O14525 1302 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PINLYPA6NC86 204 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TVP23AA6NH52 213 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRPC5OSA6NMA1 111 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLLNB2CW77 178 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 M0R1B8 84 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSPHP1O15172 72 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANGPTL7O43827 346 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTTG1O95997 202 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TPM3P06753 285 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GGT2P36268 569 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDNFQ49AH0 187 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IDNKQ5T6J7 187 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STEAP4Q687X5 459 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DNAJC24Q6P3W2 148 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SSX7Q7RTT5 188 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MDP1Q86V88 176 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRC6Q86X45 466 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ERO1BQ86YB8 467 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR51Q1Q8NH59 317 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 COQ8AQ8NI60 647 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NT5CQ8TCD5 201 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM104AQ969W3 186 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CPB2Q96IY4 423 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q96MT0 163 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2M4Q96R27 311 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GABRG3Q99928 467 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MANBAO00462 879 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHST10O43529 356 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSMB2P49721 201 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR12D2P58182 307 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CACNG7P62955 275 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRADDP78560 199 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STX4Q12846 297 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRDNQ13061 729 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PNOCQ13519 176 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACBD4Q8NC06 268 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR26Q8NDV2 337 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SERPINB11Q96P15 392 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RSG1Q9BU20 258 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms