RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 PEX14O75381 377 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 PF4V1P10720 104 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 RAB13P51153 203 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 CD83Q01151 205 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OR5D13Q8NGL4 314 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 DNTTIP1Q9H147 329 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 E9PQ18 207 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-DQA2P01906 255 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 SLC2A1P11166 492 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 PLA1AQ53H76 456 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 DRAM2Q6UX65 266 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 MKXQ8IYA7 352 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 MED30Q96HR3 178 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS22Q9GZN4 317 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 FN3KQ9H479 309 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 NKX6-3A6NJ46 265 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 RENP00797 406 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 PF4P02776 101 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OMPP47874 163 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 PRKXP51817 358 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 CAV3P56539 151 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM219Q86XT9 240 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 DYNAPQ8N1N2 210 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TCF19Q9Y242 345 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 A6NDX4 124 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 FAM220BPB1ANY3 271 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 SIGLEC5O15389 551 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 DDOSTP39656 456 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 MXRA7P84157 204 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OR5AU1Q8NGC0 362 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OR4K13Q8NH42 304 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 MUC13Q9H3R2 512 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 DNAH1Q9P2D7 4330 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 UNC119BA6NIH7 251 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TIPRLO75663 272 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 PSKH1P11801 424 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ERVFRD-1P60508 538 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 BLCAPP62952 87 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 FAM3AP98173 230 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 SPSB4Q96A44 273 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OPA3Q9H6K4 179 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TMBIM4Q9HC24 238 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 U3KQK5 164 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 DNAH7Q8WXX0 4024 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OR6C68A6NDL8 312 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 VGLL3A8MV65 326 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 AKR7A2O43488 359 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 XRCC2O43543 280 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF823P16415 610 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 GABRA2P47869 451 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 IFI44LQ53G44 452 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC121Q6ZUS5 278 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ZNRF1Q8ND25 227 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T12Q8NG77 320 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD19PQ9H560 264 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD12-201ENST00000404162 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
HOXD12-201ENST00000404162 TVP23AA6NH52 213 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf84H3BNL1 204 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SYNGR1O43759 233 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF682O95780 498 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXD12-201ENST00000404162 COX7A1P24310 79 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXD12-201ENST00000404162 LGALS4P56470 323 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RNF144BQ7Z419 303 aa15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms