RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 GHRLQ9UBU3 117 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PP11 408 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 TSPAN9O75954 239 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PPIAP62937 165 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 ARFRP1Q13795 201 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF273Q14593 569 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC36Q8IYA8 594 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 ARMC10Q8N2F6 343 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0B4J2A0 478 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 SIGLEC6O43699 453 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 SFT2D2O95562 160 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 MSR1P21757 451 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 CSNK1A1P48729 337 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 ELP2Q6IA86 826 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 FAM89BQ8N5H3 189 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 CLDN23Q96B33 292 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 C5orf66Q9H5L9 145 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 SHPKQ9UHJ6 478 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 CSAG2Q9Y5P2 127 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 IGLV3-1P01715 115 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 GP1BAP07359 652 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 FPR2P25090 351 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 THBS4P35443 961 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 NPY4RP50391 375 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF160Q9HCG1 818 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 APOC3P02656 99 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 AMY2BP19961 511 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PCOLCEQ15113 449 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 GJC3Q8NFK1 279 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 OR51T1Q8NGJ9 327 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM230Q96A57 120 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PI4KAP42356 2102 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 ALDH3B1P43353 468 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 KISS1Q15726 138 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 C10orf128Q5T292 105 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 DCUN1D4Q92564 292 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 NELFAQ9H3P2 528 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 RAB18Q9NP72 206 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PTGFRP43088 359 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 H3F3AP84243 136 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 STOML3Q8TAV4 291 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM54Q969K7 222 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 LYZL4Q96KX0 146 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PIGMQ9H3S5 423 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 WDR54Q9H977 334 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0U1RQV5 110 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 E9PLN8 166 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 WDPCPO95876 746 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 LYSMD4Q5XG99 296 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 OR5AP2Q8NGF4 316 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 SAP25Q8TEE9 199 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PIK3IP1Q96FE7 263 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 OCIAD1Q9NX40 245 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 F8VVB4 439 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 F8VWA3 439 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 TOR1AO14656 332 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 PGAM2P15259 253 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 OR3A2P47893 321 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 TAS2R46P59540 309 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 CLEC18BQ6UXF7 455 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 LHFPL1Q86WI0 220 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 ESX1Q8N693 406 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 V9GYS6 101 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD13-201ENST00000392539 NAT2P11245 290 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OPN5Q6U736 354 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 RNF126Q9BV68 326 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 DHRS3O75911 302 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 UQCC3Q6UW78 93 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 BPIFCQ8NFQ6 507 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 OR13G1Q8NGZ3 307 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 FAM117AQ9C073 453 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 C5orf63A6NC05 138 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 FGF5P12034 268 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 TPT1P13693 172 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SLC6A9P48067 706 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 SLC9A3R2Q15599 337 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 Q7L0L9 218 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 PP6455Q8WZ26 134 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 MARC2Q969Z3 335 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD13-201ENST00000392539 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms