RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 MZT2AQ6P582 158 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 C22orf34Q6ZV56 151 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MOB3CQ70IA8 216 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 UTS2BQ765I0 119 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR5AS1Q8N127 324 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 JAGN1Q8N5M9 183 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 BHLHE23Q8NDY6 225 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NUP37Q8NFH4 326 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SYNPRQ8TBG9 265 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A46Q96AG3 418 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 HAVCR1Q96D42 359 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GPER1Q99527 375 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CHST5Q9GZS9 411 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ABCB9Q9NP78 766 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GPR173Q9NS66 373 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CMAHPQ9Y471 501 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SHISA3A0PJX4 238 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF850A8MQ14 1090 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GMDSO60547 372 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NCR1O76036 304 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ACKR3P25106 362 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF404Q494X3 552 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ADAM5Q6NVV9 412 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 LRRTM1Q86UE6 522 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR8S1Q8NH09 359 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MCFD2Q8NI22 146 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PIGTQ969N2 578 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 BORCS8Q96FH0 119 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 DUSP13Q9UII6 198 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GPR160Q9UJ42 338 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FZR1Q9UM11 496 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RNF115Q9Y4L5 304 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MPC1Q9Y5U8 109 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ESPL1Q14674 2120 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CACNA1CQ13936 2221 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PLSCR5A0PG75 271 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM64BA6NI03 449 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 IQCF6A8MYZ5 107 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RGS5O15539 181 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM127O75204 238 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CST4P01036 141 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ALDOBP05062 364 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 S100A5P33763 92 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MPV17P39210 176 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ATP1B3P54709 279 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CAV3P56539 151 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR10A3P58181 314 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PSG7Q13046 419 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PRDX4Q13162 271 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 HES5Q5TA89 166 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SFXN4Q6P4A7 337 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR51A2Q8NGJ7 313 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF671Q8TAW3 534 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SSC4DQ8WTU2 575 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NPRL2Q8WTW4 380 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FAM222BQ8WU58 562 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ACOT12Q8WYK0 555 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SPSB1Q96BD6 273 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CEP19Q96LK0 163 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SORCS2Q96PQ0 1159 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 S100A13Q99584 98 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MRI1Q9BV20 369 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SLC22A4Q9H015 551 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM100Q9NV29 134 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ALX3O95076 343 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 KITLGP21583 273 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FUT6P51993 359 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CAPZA1P52907 286 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MZT1Q08AG7 82 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TNK1Q13470 666 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR8G1Q15617 311 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2V2Q15819 145 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 RAB11BQ15907 218 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CDH26Q8IXH8 852 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DNAAF1Q8NEP3 725 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms