RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 TGOLN2O43493 480 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 COX6B1P14854 86 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 THBS4P35443 961 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 RHOBP62745 196 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SSPNQ14714 243 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 IGFBP7Q16270 282 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 FOXB1Q99853 325 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 hADV38S2A0JD32 116 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 E5RGE8 158 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 K7ESF4 209 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 M0R296 226 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TCRBP04435 133 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 OR4A8P0C604 315 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 OR3A4PP47883 348 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 PRR27Q6MZM9 219 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TMUB2Q71RG4 321 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 WFDC5Q8TCV5 224 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 COA4Q9NYJ1 87 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 JTBO76095 146 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ATF1P18846 271 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 FCGR2CP31995 323 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 LGALS7P47929 136 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 PRDX4Q13162 271 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 PRR7Q8TB68 274 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ERGIC1Q969X5 290 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TM4SF19Q96DZ7 209 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 MISP3Q96FF7 219 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 C20orf24Q9BUV8 137 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 PRRT4C9JH25 899 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SIAH2O43255 324 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 KLKB1P03952 638 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 OPRK1P41145 380 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ASCL1P50553 236 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 H3F3AP84243 136 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SMUG1Q53HV7 270 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TOR2AQ5JU69 321 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM123Q8N131 208 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 GALNT16Q8N428 558 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SULT1A3P0DMM9 295 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SULT1A4P0DMN0 295 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 OR5H8P0DN80 308 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 COX7A1P24310 79 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 S100A11P31949 105 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 BTG2P78543 158 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 RTP5Q14D33 572 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ACSM6Q6P461 480 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 OR4C3Q8NH37 302 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TVP23CQ96ET8 276 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TEX101Q9BY14 249 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TBX21Q9UL17 535 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 CXCL10P02778 98 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 RRASP10301 218 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 GABRA1P14867 456 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 DIO1P49895 249 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 CCR6P51684 374 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 CLLU1Q5K131 121 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SYS1Q8N2H4 156 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 GNRHR2Q96P88 292 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ARHGDIGQ99819 225 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 RAB18Q9NP72 206 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 NAGKQ9UJ70 344 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 NSG2Q9Y328 171 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 A0A1W2PR48 441 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ARNTP27540 789 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 EMDP50402 254 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ASCL5Q7RTU5 278 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 OR10R2Q8NGX6 335 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 OR13G1Q8NGZ3 307 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ASB5Q8WWX0 329 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 ASB13Q8WXK3 278 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-202ENST00000356435 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.6 ms