RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CNIH1O95406 144 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 IGHG3P01860 377 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 SCG5P05408 212 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CALCBP10092 127 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CPT2P23786 658 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 UCNP55089 124 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF616Q08AN1 781 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 FCRLAQ7L513 359 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CDC20BQ86Y33 519 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 DOK1Q99704 481 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 MCUBQ9NWR8 336 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF716A6NP11 495 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 H3BMQ9 156 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 PHYHO14832 338 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TNFRSF6BO95407 300 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 HLA-DQA2P01906 255 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CEACAM3P40198 252 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 UBE2KP61086 200 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 C3AR1Q16581 482 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 HIST3H3Q16695 136 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZS92 163 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TMEM54Q969K7 222 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 RBP7Q96R05 134 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 OR2M2Q96R28 347 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TIMP4Q99727 224 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 WDR76Q9H967 626 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 NDRG3Q9UGV2 375 aa5.35□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 M0R036 132 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 SYNGR4O95473 234 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 RAF1P04049 648 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 HEXAP06865 529 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CPN1P15169 458 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 THBS4P35443 961 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 PLA2G5P39877 138 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ACSM1Q08AH1 577 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 SSX1Q16384 188 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 XKRXQ6PP77 449 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ERASQ7Z444 233 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 P2RY8Q86VZ1 359 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 KBTBD8Q8NFY9 601 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 OR6N2Q8NGY6 317 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF479Q96JC4 524 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQ09 198 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 HPGDSO60760 199 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 PAX6P26367 422 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 NFATC3Q12968 1075 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TRIQKQ629K1 86 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 SSX7Q7RTT5 188 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 SIAH3Q8IW03 269 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TMEM123Q8N131 208 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 C4orf36Q96KX1 117 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TAAR6Q96RI8 345 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 A0A0B4J293 547 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 J3QLW9 94 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF432O94892 652 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 GABARAPO95166 117 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 MPZL1O95297 269 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 IFNA7P01567 189 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 MT-ND5P03915 603 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 NPSP0C0P6 89 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 ZNF19P17023 458 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 GADD45AP24522 165 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 SELENOPP49908 381 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CXADRP78310 365 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 CTF1Q16619 201 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 MEP1BQ16820 701 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.34□□□□□ -1.55
CCR6-201ENST00000341935 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.34□□□□□ -1.55
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