RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 VSIG8P0DPA2 414 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SLC2A1P11166 492 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CHATP28329 748 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 AVPR2P30518 371 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 GNRHRP30968 328 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 HTR5AP47898 357 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ZNF616Q08AN1 781 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 AVPI1Q5T686 147 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 MS4A18H0YCH9 400 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 COL4A3Q01955 1670 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 E5RGE8 158 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 ABOP16442 354 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SDHBP21912 280 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 DUSP1P28562 367 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 GABRA4P48169 554 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 FXYD4P59646 89 aa7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PIGTQ969N2 578 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 FAM206AQ9NX38 181 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.85□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 CBR3O75828 277 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 FGF2P09038 288 aa7.85□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 HOGA1Q86XE5 327 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 FBXW5Q969U6 566 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CMBLQ96DG6 245 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.85□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 LRP5LA4QPB2 252 aa7.85□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 OR8U9P0C7N5 309 aa7.85□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SGCZQ96LD1 299 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 GPR27Q9NS67 375 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PRR32B1ATL7 298 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CST4P01036 141 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 IL2RAP01589 272 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 TK1P04183 234 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CTXN2P0C2S0 81 aa7.84□□□□□ -1.15
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