RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 OPA3Q9H6K4 179 aa14.54□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 NEK6Q9HC98 313 aa14.54□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.54□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.54□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 RAB22AQ9UL26 194 aa14.54□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 DOCK7Q96N67 2140 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 A0A0A6YYH2 397 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 A6NJ64 397 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 CBR1P16152 277 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 HOXC12P31275 282 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 INPP1P49441 399 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 QRFPP83859 136 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 KISS1Q15726 138 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 KRT74Q7RTS7 529 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 WDR31Q8NA23 367 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 YIPF5Q969M3 257 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 SPSB1Q96BD6 273 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 KCNK15Q9H427 330 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.53□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 GGT3PA6NGU5 568 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 LANCL1O43813 399 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 GMDSO60547 372 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 ICMTO60725 284 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 UBBP0CG47 229 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 PRKACBP22694 351 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 ALDH3B1P43353 468 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 TAS2R20P59543 309 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 AWAT2Q6E213 333 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 BIVMQ86UB2 503 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 PHF21AQ96BD5 680 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 TECTBQ96PL2 329 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 SPACA5Q96QH8 159 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 GPER1Q99527 375 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 SLC22A4Q9H015 551 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 GHRLQ9UBU3 117 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 STARD10Q9Y365 291 aa14.52□□□□□ -0.08
TVP23C-201ENST00000225576 IGF2RP11717 2491 aa14.52□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.52□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 GABARAPH6UMI1 98 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 NRASP01111 189 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 NGFP01138 241 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 VSIG8P0DPA2 414 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 WNT5AP41221 380 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 RFX2P48378 723 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 DGCR2P98153 550 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TSC22D1Q15714 1073 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 RNF144BQ7Z419 303 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 GPR173Q9NS66 373 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 GTF3C1Q12789 2109 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZZEF1O43149 2961 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 RTTNQ86VV8 2226 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 A0A1W2PR80 420 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 IGKV3-15P01624 115 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 NAT2P11245 290 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 OPRM1P35372 400 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PTGFRP43088 359 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 OR3A4PP47883 348 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 RBPJQ06330 500 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PMPCAQ10713 525 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 KLRB1Q12918 225 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.51□□□□□ -0.09
TVP23C-201ENST00000225576 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms