RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI2	YOL007C	GMH1	P36125	273 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	APT2	P36973	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	CAN1	P04817	590 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	XBP1	P40489	647 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	NET1	P47035	1189 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	HUL5	P53119	910 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	RGT2	Q12300	763 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	STE12	P13574	688 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	LTP1	P40347	161 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	BNA2	P47125	453 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	FMP30	Q02883	468 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	NUP1	P20676	1076 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	KCC4	P25389	1037 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	YMC2	P38087	329 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	YFL052W	P43551	465 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	PEX1	P24004	1043 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	MIT1	P40002	666 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	BUD6	P41697	788 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	YGR151C	P53287	111 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	SPC98	P53540	846 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	DOS2	P54858	310 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	REC102	Q02721	264 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	PHO5	P00635	467 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	YUR1	P26725	428 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	YMC1	P32331	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	MTC2	P34246	357 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	MCD4	P36051	919 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
CSI2	YOL007C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	ECM3	Q99252	613 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	CIT2	P08679	460 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	GAL11	P19659	1081 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	BCS1	P32839	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	NPY1	P53164	384 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	RNH70	P53331	553 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	MPS1	P54199	764 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	THI22	Q06490	572 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSI2	YOL007C	APN1	P22936	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	PPG1	P32838	368 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	YKR051W	P36142	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	YNL195C	P40168	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	GID8	P40208	455 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	TAX4	P47030	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	COX18	P53239	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	HFD1	Q04458	532 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	CIR2	Q08822	631 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	BIT2	P38346	545 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	LAM4	P38800	1345 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	RAD18	P10862	487 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	ABF1	P14164	731 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	MIH1	P23748	554 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	BRN1	P38170	754 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	GDH3	P39708	457 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	PIG2	P40187	538 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	NUP82	P40368	713 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	NMA2	P53204	395 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	PHO8	P11491	566 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	PRP28	P23394	588 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	MBR1	P23493	339 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	SEC6	P32844	805 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	MAL11	P53048	616 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	ALG12	P53730	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	ARP4	P80428	489 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	ULA1	Q12059	462 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSI2	YOL007C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10 ms