RNA–Protein interactions for RNA: YDL069C

CBS1, Mitochondrial translational activator of the COB mRNA, yeast

Gene CBS1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBS1	YDL069C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	PER1	P25625	357 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	ULA1	Q12059	462 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	ALG2	P43636	503 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	ORC4	P54791	529 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	ATP25	Q03153	612 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	HOT13	P36078	116 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	ALY2	P47029	1046 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CBS1	YDL069C	ABF1	P14164	731 aa		4.33	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	NMA2	P53204	395 aa		4.32	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	LAM4	P38800	1345 aa		4.31	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	PEX1	P24004	1043 aa		4.31	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.31	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.31	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	BCS1	P32839	456 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	IRC8	P47046	822 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.3	□□□□□ -1.72	not detected
CBS1	YDL069C	TAF8	Q03750	510 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	CIT1	P00890	479 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	REC102	Q02721	264 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	ECM3	Q99252	613 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	TPK2	P06245	380 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	BET3	P36149	193 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	BIT2	P38346	545 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	PMT6	P42934	759 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	COX18	P53239	316 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CBS1	YDL069C	RAD18	P10862	487 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	RAD4	P14736	754 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	PIG2	P40187	538 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	HUL4	P40985	892 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	YFL052W	P43551	465 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	PIP2	P52960	996 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	ORM2	Q06144	216 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	THI22	Q06490	572 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	BNA2	P47125	453 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	PRP28	P23394	588 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	MPS3	P47069	682 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	ARG7	Q04728	441 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	AAD3	P25612	363 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	APL3	P38065	1025 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	YNL195C	P40168	261 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	RKI1	Q12189	258 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	FRE7	Q12333	620 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	CTP1	P38152	299 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CBS1	YDL069C	BEM3	P32873	1128 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	GID8	P40208	455 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	KHA1	P40309	873 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	TIM54	P47045	478 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	RFX1	P48743	811 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	NPY1	P53164	384 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	DIP5	P53388	608 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	SEC6	P32844	805 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	RTA1	P53047	317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	ATP23	P53722	227 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	VPS36	Q06696	566 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	YEL1	P34225	687 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	IRC3	Q06683	689 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	EUG1	P32474	517 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	YGL117W	P53133	265 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	VBA3	P25594	458 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	YKR051W	P36142	418 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	SNF12	P53628	566 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	FLC1	Q08967	793 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	MCD4	P36051	919 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	YIL077C	P40508	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CBS1	YDL069C	MAF1	P41910	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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