RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		20.75	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		20.75	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	PASK	Q96RG2	1323 aa		20.75	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHTN1	A0MZ66	631 aa		20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLRG1	Q96E93	195 aa		20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNAP23	O00161	211 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNAI3	P08754	354 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLRK1	P26718	216 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE4A	Q14139	1066 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	METTL24	Q5JXM2	366 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	OGFOD1	Q8N543	542 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD209	Q9NNX6	404 aa		20.73	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L8	P0C7I0	530 aa		20.72	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM27	P14373	513 aa		20.72	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	20.72	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		20.72	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		20.72	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTF2I	P78347	998 aa		20.71	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		20.71	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		20.71	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		20.71	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	20.71	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		20.71	■□□□□ 0.91
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC24	Q50LG9	513 aa		20.7	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	DACT2	Q5SW24	774 aa		20.7	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		20.7	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	MEIS3	Q99687	375 aa		20.7	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	VPS37D	Q86XT2	251 aa		20.69	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	20.69	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		20.69	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	20.69	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCN9A	Q15858	1988 aa		20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAF5	O00463	557 aa		20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	GML	Q99445	158 aa		20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	MXD3	Q9BW11	206 aa		20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	EYA2	O00167	538 aa		20.67	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDE8B	O95263	885 aa		20.67	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	EGFR	P00533	1210 aa		20.67	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	MMP14	P50281	582 aa		20.67	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		20.67	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP48	Q86UV5	1035 aa		20.67	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL1R1	P14778	569 aa		20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCARF1	Q14162	830 aa		20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	SULF1	Q8IWU6	871 aa		20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO3	Q9UK99	471 aa		20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNN	Q9UQP3	1299 aa		20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF609	O15014	1411 aa		20.66	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNAI2	P04899	355 aa		20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	GYG1	P46976	350 aa		20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	SIL1	Q9H173	461 aa		20.65	■□□□□ 0.9
JMJD1C-211	ENST00000633035	SASH1	O94885	1247 aa		20.64	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	20.64	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	20.64	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		20.64	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	20.64	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		20.64	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRGAP3	O43295	1099 aa		20.63	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	GGA3	Q9NZ52	723 aa		20.63	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	CIAO1	O76071	339 aa		20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC5A1	P13866	664 aa		20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	CST9	Q5W186	159 aa		20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	JMY	Q8N9B5	988 aa		20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	JAG2	Q9Y219	1238 aa		20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSME4	Q14997	1843 aa		20.62	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035		F8W031	263 aa	Predicted RBP	20.61	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	MS4A1	P11836	297 aa		20.61	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	20.61	■□□□□ 0.89
JMJD1C-211	ENST00000633035	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	20.61	■□□□□ 0.89

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