RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	COA1	Q9GZY4	146 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TCF4-259	ENST00000627568	GGA3	Q9NZ52	723 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		32.51	■■■□□ 2.8
TCF4-259	ENST00000627568	GRM8	O00222	908 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	USP17L8	P0C7I0	530 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	SULF1	Q8IWU6	871 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	FBXW7	Q969H0	707 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	FOXO4	P98177	505 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	CHRND	Q07001	517 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	GML	Q99445	158 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	ADM5	C9JUS6	153 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568		E9PSI1	815 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	MAP2K2	P36507	400 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	LBX1	P52954	281 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	HUNK	P57058	714 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	SCARF1	Q14162	830 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	DLK2	Q6UY11	383 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	OGFOD1	Q8N543	542 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TCF4-259	ENST00000627568	DACT2	Q5SW24	774 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	AOC2	O75106	756 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	KLRK1	P26718	216 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	CAPN15	O75808	1086 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	MXD3	Q9BW11	206 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	TAF5L	O75529	589 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	CDCA5	Q96FF9	252 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TCF4-259	ENST00000627568	PTPRC	P08575	1304 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	MMP14	P50281	582 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	NOG	Q13253	232 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	GTF2I	P78347	998 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	RGMB	Q6NW40	437 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	CD209	Q9NNX6	404 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	SNAP23	O00161	211 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	SUCLG2	Q96I99	432 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	CA12	O43570	354 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	PLIN1	O60240	522 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TCF4-259	ENST00000627568	UTY	O14607	1347 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC102A	Q96A19	550 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	WNT10B	O00744	389 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	FKBP1B	P68106	108 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	SASH1	O94885	1247 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	KAZALD1	Q96I82	304 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	IL1R1	P14778	569 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	TSKS	Q9UJT2	592 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TCF4-259	ENST00000627568	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	NF2	P35240	595 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	UBE4A	Q14139	1066 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	ZIC5	Q96T25	663 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	SLC10A3	P09131	477 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms