RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 MCOLN1Q9GZU1 580 aa31.93■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa31.93■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 GCKRQ14397 625 aa31.92■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G12BQ9BX93 195 aa31.92■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 SLC10A3P09131 477 aa31.91■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 SAGE1Q9NXZ1 904 aa31.91■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 FLIIQ13045 1269 aa31.9■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 DACT2Q5SW24 774 aa31.9■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 LEMD3Q9Y2U8 911 aa31.9■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 SPEF2Q9C093 1822 aa31.89■■■□□ 2.7
PTPRF-216ENST00000617451 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
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PTPRF-216ENST00000617451 MXD3Q9BW11 206 aa31.88■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA6P23229 1130 aa31.87■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 DGKZQ13574 1117 aa31.87■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 FAM161AQ3B820 660 aa31.87■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 STRIP1Q5VSL9 837 aa31.87■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 TXNRD3Q86VQ6 643 aa31.87■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 FANCIQ9NVI1 1328 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 CSF1RP07333 972 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 RGS19P49795 217 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
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PTPRF-216ENST00000617451 DNAAF4Q8WXU2 420 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 CSRNP1Q96S65 589 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 MYH16Q9H6N6 1097 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 RNF186Q9NXI6 227 aa31.86■■■□□ 2.69
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PTPRF-216ENST00000617451 OGFOD1Q8N543 542 aa31.85■■■□□ 2.69
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PTPRF-216ENST00000617451 MPHOSPH8Q99549 860 aa31.84■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 VAMP4O75379 141 aa31.83■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 TRPA1O75762 1119 aa31.83■■■□□ 2.69
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
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PTPRF-216ENST00000617451 WNT10BO00744 389 aa31.82■■■□□ 2.68
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PTPRF-216ENST00000617451 MRS2Q9HD23 443 aa31.82■■■□□ 2.68
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PTPRF-216ENST00000617451 WDR63Q8IWG1 891 aa31.81■■■□□ 2.68
PTPRF-216ENST00000617451 CACNA1FO60840 1977 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRF-216ENST00000617451 TTLL5Q6EMB2 1281 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRF-216ENST00000617451 MOB2Q70IA6 237 aa31.8■■■□□ 2.68
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PTPRF-216ENST00000617451 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
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PTPRF-216ENST00000617451 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
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PTPRF-216ENST00000617451 HDAC9Q9UKV0 1011 aa31.74■■■□□ 2.67
PTPRF-216ENST00000617451 IRS2Q9Y4H2 1338 aa31.74■■■□□ 2.67
PTPRF-216ENST00000617451 F6X3S4 739 aa31.73■■■□□ 2.67
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PTPRF-216ENST00000617451 TAF5LO75529 589 aa31.7■■■□□ 2.67
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PTPRF-216ENST00000617451 CERS5Q8N5B7 392 aa31.67■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 TM4SF4P48230 202 aa31.66■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 EPHA10Q5JZY3 1008 aa31.66■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 LMBR1LQ6UX01 489 aa31.66■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
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PTPRF-216ENST00000617451 MTMR14Q8NCE2 650 aa31.65■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 GRM8O00222 908 aa31.64■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 IL1R1P14778 569 aa31.64■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 DLGAP5Q15398 846 aa31.64■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF804AQ7Z570 1209 aa31.64■■■□□ 2.66
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC57Q2TAC2 916 aa31.63■■■□□ 2.65
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D8O95759 1140 aa31.62■■■□□ 2.65
PTPRF-216ENST00000617451 PRKG1Q13976 671 aa31.62■■■□□ 2.65
PTPRF-216ENST00000617451 LDLRAD1Q5T700 205 aa31.62■■■□□ 2.65
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB129Q9H1M3 183 aa31.62■■■□□ 2.65
PTPRF-216ENST00000617451 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
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