RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBXO3Q9UK99 471 aa12.97□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHD4Q14839 1912 aa12.97□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.96□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBE4AQ14139 1066 aa12.96□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RNF181Q9P0P0 153 aa12.96□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 JAG2Q9Y219 1238 aa12.96□□□□□ -0.33
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A1B0GUL7 405 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 YDJCA8MPS7 323 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LMNB1P20700 586 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TNNI3KQ59H18 835 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SKAP1Q86WV1 359 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SUPT20HQ8NEM7 779 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 XAGE2Q96GT9 111 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DBNDD2Q9BQY9 259 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.95□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB11FIP3O75154 756 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC5A1P13866 664 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PHKA1P46020 1223 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBXO33Q7Z6M2 555 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AACSQ86V21 672 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LPIN2Q92539 896 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EYA3Q99504 573 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MXD3Q9BW11 206 aa12.94□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCN9AQ15858 1988 aa12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ECE2O60344 883 aa12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAD17O75943 681 aa12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ERC1Q8IUD2 1116 aa12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CD209Q9NNX6 404 aa12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF541Q9H0D2 1346 aa12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 G3V3G9 751 aa12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMC5Q8IY18 1101 aa12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NIM1KQ8IY84 436 aa12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AKAP2Q9Y2D5 859 aa12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MED23Q9ULK4 1368 aa12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF609O15014 1411 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CXCL9Q07325 125 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCARF1Q14162 830 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSHZ3Q63HK5 1081 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC102BQ68D86 513 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GCC1Q96CN9 775 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LNPKQ9C0E8 428 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GPR108Q9NPR9 543 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNRF3Q9ULT6 936 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa12.91□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FZD9O00144 591 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PI16Q6UXB8 463 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 JDP2Q8WYK2 163 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBXW7Q969H0 707 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COA1Q9GZY4 146 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SNRKQ9NRH2 765 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.9□□□□□ -0.34
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SHTN1A0MZ66 631 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DDNO94850 711 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IL1R1P14778 569 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GTF2IP78347 998 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NUCB1Q02818 461 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRIK5Q16478 980 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAVIN4Q5BKX8 364 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GORABQ5T7V8 394 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF804AQ7Z570 1209 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VPS37DQ86XT2 251 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VPS33BQ9H267 617 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GJA3Q9Y6H8 435 aa12.89□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PSMD14O00487 310 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PDE4AP27815 886 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHD1LQ86WJ1 897 aa12.88□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MCAMP43121 646 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EIF6P56537 245 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RASGRF1Q13972 1273 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TTC39AQ5SRH9 613 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TTLL5Q6EMB2 1281 aa12.87□□□□□ -0.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms