RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 KLRK1P26718 216 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 KLRG1Q96E93 195 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-214ENST00000601319 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.58■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 SHTN1A0MZ66 631 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 TAF5LO75529 589 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 GMLQ99445 158 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 BCAR3O75815 825 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 TRIM27P14373 513 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 PCNTO95613 3336 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 DACT2Q5SW24 774 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 SNAP23O00161 211 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 UBE4AQ14139 1066 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 CD209Q9NNX6 404 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 EGFRP00533 1210 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 USP17L8P0C7I0 530 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 IL1R1P14778 569 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 MMP14P50281 582 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 JMYQ8N9B5 988 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 MEIS3Q99687 375 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-214ENST00000601319 GNAI3P08754 354 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 CNTNAP1P78357 1384 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 PLIN1O60240 522 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 LRRC24Q50LG9 513 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 FBXO3Q9UK99 471 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 EYA2O00167 538 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 TRAF5O00463 557 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 PDE8BO95263 885 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 METTL24Q5JXM2 366 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 TNNQ9UQP3 1299 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 CIAO1O76071 339 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 GTF2IP78347 998 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 MTX1Q13505 466 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 FBXW7Q969H0 707 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 RASSF10A6NK89 507 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 OGFOD1Q8N543 542 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 MXD3Q9BW11 206 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-214ENST00000601319 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 CST9Q5W186 159 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 GGA3Q9NZ52 723 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 SASH1O94885 1247 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 FGFR2P21802 821 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 GYG1P46976 350 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 CERS5Q8N5B7 392 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 COPRSQ9NQ92 184 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 GNAI2P04899 355 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 SCARF1Q14162 830 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-214ENST00000601319 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.42■■□□□ 1.02
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