RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 TRIM17Q9Y577 477 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 LAMB1P07942 1786 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 RUNDC1Q96C34 613 aa17.16■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 MXD3Q9BW11 206 aa17.16■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 ATP2B4P23634 1241 aa17.15■□□□□ 0.34
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CTIF-211ENST00000592658 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.15■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 RIC3Q7Z5B4 369 aa17.15■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 IFNL1Q8IU54 200 aa17.15■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 MED23Q9ULK4 1368 aa17.15■□□□□ 0.34
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CTIF-211ENST00000592658 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-211ENST00000592658 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-211ENST00000592658 CCDC191Q8NCU4 936 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-211ENST00000592658 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-211ENST00000592658 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-211ENST00000592658 ZNF853P0CG23 659 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-211ENST00000592658 CAP1Q01518 475 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-211ENST00000592658 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.1■□□□□ 0.33
CTIF-211ENST00000592658 ERO1AQ96HE7 468 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-211ENST00000592658 WNK4Q96J92 1243 aa17.1■□□□□ 0.33
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CTIF-211ENST00000592658 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
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CTIF-211ENST00000592658 TXNRD3Q86VQ6 643 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 COA1Q9GZY4 146 aa17.08■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 CRHR2Q13324 411 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 FBXW7Q969H0 707 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 ZNF333Q96JL9 665 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 DEFB129Q9H1M3 183 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 EFCC1Q9HA90 598 aa17.07■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 UNCXA6NJT0 531 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 GJA5P36382 358 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 CTSWP56202 376 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 TTLL5Q6EMB2 1281 aa17.06■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 KIAA0825Q8IV33 1275 aa17.06■□□□□ 0.32
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CTIF-211ENST00000592658 SP3Q02447 781 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 TTLL11Q8NHH1 800 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 OTUD5Q96G74 571 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 PTPN18Q99952 460 aa17.05■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 MYH3P11055 1940 aa17.04■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 GREM2Q9H772 168 aa17.04■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa17.04■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.04■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 ECM29Q5VYK3 1845 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 DDX58O95786 925 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 IGKV5-2P06315 115 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 KLRK1P26718 216 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 GNAI1P63096 354 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 MTMR14Q8NCE2 650 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 TMEM106CQ9BVX2 250 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 LEMD3Q9Y2U8 911 aa17.03■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 ZNF804BA4D1E1 1349 aa17.02■□□□□ 0.32
CTIF-211ENST00000592658 GTF2IP78347 998 aa17.02■□□□□ 0.32
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