RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	TRAF5	O00463	557 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	TAF5L	O75529	589 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	KLRK1	P26718	216 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	EGFR	P00533	1210 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	32.37	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	FBXW7	Q969H0	707 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	GML	Q99445	158 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	USP17L8	P0C7I0	530 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	RASSF10	A6NK89	507 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	DACT2	Q5SW24	774 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	SNAP23	O00161	211 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	PLIN1	O60240	522 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	CST9	Q5W186	159 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PTPRS-209	ENST00000591760	CD209	Q9NNX6	404 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	VEGFB	P49765	207 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	USP48	Q86UV5	1035 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	OGFOD1	Q8N543	542 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	GGA3	Q9NZ52	723 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	MXD3	Q9BW11	206 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	MMP14	P50281	582 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	GTF2I	P78347	998 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	UBE4A	Q14139	1066 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	SULF1	Q8IWU6	871 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PTPRS-209	ENST00000591760	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	IL1R1	P14778	569 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	SCARF1	Q14162	830 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	ADM5	C9JUS6	153 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	ECE1	P42892	770 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	LRRC24	Q50LG9	513 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	METTL24	Q5JXM2	366 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	CAPNS2	Q96L46	248 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PTPRS-209	ENST00000591760	BCAR3	O75815	825 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	DLK2	Q6UY11	383 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	PDE8B	O95263	885 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	TRIM27	P14373	513 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	MEIS3	Q99687	375 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	WNT10B	O00744	389 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	SASH1	O94885	1247 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	GYG1	P46976	350 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	CERS5	Q8N5B7	392 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74

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