RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591152.5

PSME3-211, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene PSME3, Length 1,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-211ENST00000591152 MYD88Q99836 296 aa27.09■■□□□ 1.93
PSME3-211ENST00000591152 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PSME3-211ENST00000591152 DACT2Q5SW24 774 aa27.08■■□□□ 1.93
PSME3-211ENST00000591152 OTOP1Q7RTM1 612 aa27.08■■□□□ 1.93
PSME3-211ENST00000591152 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.08■■□□□ 1.93
PSME3-211ENST00000591152 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PSME3-211ENST00000591152 PDE8AO60658 829 aa27.07■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 ALDH1A1P00352 501 aa27.07■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 HTTP42858 3142 aa27.07■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 GOLGA2Q08379 1002 aa27.06■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 HOXB7P09629 217 aa27.05■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.05■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.05■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 IFNL1Q8IU54 200 aa27.04■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 CENPFP49454 3210 aa27.04■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 EN2P19622 333 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.03■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.03■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 STRIP1Q5VSL9 837 aa27.02■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PSME3-211ENST00000591152 MED23Q9ULK4 1368 aa27.01■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 MYO3BQ8WXR4 1341 aa27.01■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.01■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.01■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.01■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.01■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 PTPN22Q9Y2R2 807 aa27.01■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 INHBEP58166 350 aa26.99■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.99■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.99■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.98■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 ERO1AQ96HE7 468 aa26.98■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 COA1Q9GZY4 146 aa26.98■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 BRCA2P51587 3418 aa26.97■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 WNK4Q96J92 1243 aa26.97■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.97■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 CTSWP56202 376 aa26.96■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PSME3-211ENST00000591152 CRHR2Q13324 411 aa26.95■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 GREM2Q9H772 168 aa26.95■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 EFCC1Q9HA90 598 aa26.95■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 MBIPQ9NS73 344 aa26.95■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 KLRK1P26718 216 aa26.94■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 GTF2IP78347 998 aa26.94■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 ARMC5Q96C12 935 aa26.94■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.93■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 SPEF2Q9C093 1822 aa26.93■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 CAP1Q01518 475 aa26.92■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 RUNDC1Q96C34 613 aa26.92■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.92■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 MMP14P50281 582 aa26.91■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 DLGAP5Q15398 846 aa26.91■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 MAP3K11Q16584 847 aa26.91■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.91■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.9■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 SP3Q02447 781 aa26.9■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.9■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.9■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.9■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 GJA5P36382 358 aa26.89■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.89■■□□□ 1.9
PSME3-211ENST00000591152 CLRN2A0PK11 232 aa26.88■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 MYCP01106 439 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 PTPN18Q99952 460 aa26.88■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 F8W031 263 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 RALBP1Q15311 655 aa26.87■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.86■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 ZNF333Q96JL9 665 aa26.86■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 VEZTQ9HBM0 779 aa26.86■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 IGKV5-2P06315 115 aa26.85■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 KCNJ4P48050 445 aa26.85■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.85■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 CERS5Q8N5B7 392 aa26.85■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.84■■□□□ 1.89
PSME3-211ENST00000591152 H0YGN5 161 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms