RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576119.1

ACSM2A-215, Transcript of acyl-CoA synthetase medium chain family member 2A, human

TSL 2

Gene ACSM2A, Length 1,216 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSM2A-215	ENST00000576119	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACSM2A-215	ENST00000576119	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ACSM2A-215	ENST00000576119	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ACSM2A-215	ENST00000576119	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	DPF2	Q92785	391 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	PSMD14	O00487	310 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	RALBP1	Q15311	655 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ECE2	O60344	883 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	HOXB7	P09629	217 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	UFL1	O94874	794 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	SLC34A2	O95436	690 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	RGS19	P49795	217 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	GPSM2	P81274	684 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CHL1	O00533	1208 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	TAF1	P21675	1872 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ACSM2A-215	ENST00000576119	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	TRPA1	O75762	1119 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	NUDT7	P0C024	238 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	NF2	P35240	595 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	XDH	P47989	1333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	PDE8A	O60658	829 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	EGFR	P00533	1210 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	SLC10A3	P09131	477 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	SOX10	P56693	466 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	FKBP1B	P68106	108 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ACSM2A-215	ENST00000576119	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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