RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576106.5

TRAP1-215, Transcript of TNF receptor associated protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRAP1, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAP1-215ENST00000576106 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 KLRK1P26718 216 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 PLIN1O60240 522 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF609O15014 1411 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 BCAR3O75815 825 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAP1-215ENST00000576106 SNAP23O00161 211 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 FBXW7Q969H0 707 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 USP17L8P0C7I0 530 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 GMLQ99445 158 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 CD209Q9NNX6 404 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 UBE4AQ14139 1066 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 DACT2Q5SW24 774 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 SPEF2Q9C093 1822 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 MYO3BQ8WXR4 1341 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 TRIM27P14373 513 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 JMYQ8N9B5 988 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 TRAF5O00463 557 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 EGFRP00533 1210 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 METTL24Q5JXM2 366 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
TRAP1-215ENST00000576106 GNAI3P08754 354 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 MMP14P50281 582 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 GTF2IP78347 998 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 LRRC24Q50LG9 513 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 OGFOD1Q8N543 542 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 MEIS3Q99687 375 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 IL1R1P14778 569 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 SCN9AQ15858 1988 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.55■■■□□ 2.161e-6■■■■□ 21.7
TRAP1-215ENST00000576106 MXD3Q9BW11 206 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 USP48Q86UV5 1035 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 CNTNAP1P78357 1384 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 EYA2O00167 538 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 PDE8BO95263 885 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 SCARF1Q14162 830 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 CST9Q5W186 159 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 FBXO3Q9UK99 471 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAP1-215ENST00000576106 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 GGA3Q9NZ52 723 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 TNNQ9UQP3 1299 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 RASSF10A6NK89 507 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 SASH1O94885 1247 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 GYG1P46976 350 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 SULF1Q8IWU6 871 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 VPS37DQ86XT2 251 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 CIAO1O76071 339 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.47■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 GNAI2P04899 355 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 VEGFBP49765 207 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 SIL1Q9H173 461 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.45■■■□□ 2.15
TRAP1-215ENST00000576106 ADM5C9JUS6 153 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAP1-215ENST00000576106 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAP1-215ENST00000576106 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms