RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-213	ENST00000569573	MYH3	P11055	1940 aa		32.77	■■■□□ 2.84
E2F4-213	ENST00000569573	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		32.77	■■■□□ 2.84
E2F4-213	ENST00000569573	TRPA1	O75762	1119 aa		32.76	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	FKBP1B	P68106	108 aa		32.76	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	SPEF2	Q9C093	1822 aa		32.75	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.75	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.75	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	RNF186	Q9NXI6	227 aa		32.75	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		32.74	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	G2E3	Q7L622	706 aa		32.73	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	COA1	Q9GZY4	146 aa		32.73	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573		H7C1W4	665 aa		32.72	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		32.72	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.72	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		32.72	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	RGS19	P49795	217 aa		32.71	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		32.71	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	CSRNP1	Q96S65	589 aa		32.71	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	GCKR	Q14397	625 aa		32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	DACT2	Q5SW24	774 aa		32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	MXD3	Q9BW11	206 aa		32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		32.7	■■■□□ 2.83
E2F4-213	ENST00000569573	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		32.7	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	ITGA6	P23229	1130 aa		32.69	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	KCNJ4	P48050	445 aa		32.69	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	FLII	Q13045	1269 aa		32.69	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.69	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	NF2	P35240	595 aa		32.68	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		32.68	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	IL16	Q14005	1332 aa		32.68	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.67	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		32.67	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		32.66	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		32.66	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		32.66	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	WNT10B	O00744	389 aa		32.65	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	MMP14	P50281	582 aa		32.65	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	MOB2	Q70IA6	237 aa		32.65	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.65	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		32.64	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.64	■■■□□ 2.82
E2F4-213	ENST00000569573	SASH1	O94885	1247 aa		32.62	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		32.62	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.61	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		32.61	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	GTF2I	P78347	998 aa		32.61	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	CSF1R	P07333	972 aa		32.6	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	KLRK1	P26718	216 aa		32.6	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	CHRND	Q07001	517 aa		32.6	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.6	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	CASP7	P55210	303 aa		32.59	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		32.59	■■■□□ 2.81
E2F4-213	ENST00000569573	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		32.57	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	PRKG1	Q13976	671 aa		32.55	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	CD209	Q9NNX6	404 aa		32.55	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	VAMP4	O75379	141 aa		32.54	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.54	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.53	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	TAF5L	O75529	589 aa		32.53	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	DLGAP5	Q15398	846 aa		32.53	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	TBC1D8	O95759	1140 aa		32.52	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	SOX10	P56693	466 aa		32.52	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	SREBF2	Q12772	1141 aa		32.52	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32.52	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
E2F4-213	ENST00000569573	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		32.51	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573		F6X3S4	739 aa		32.5	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	SNAP23	O00161	211 aa		32.49	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	ANP32C	O43423	234 aa		32.49	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	TM4SF4	P48230	202 aa		32.49	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	MYO1B	O43795	1136 aa		32.48	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	FOXO4	P98177	505 aa		32.48	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		32.48	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573		F8W031	263 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.47	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
E2F4-213	ENST00000569573	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		32.46	■■■□□ 2.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms