RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567432.1

GINS3-208, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene GINS3, Length 322 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-208ENST00000567432 PARP2Q9UGN5 583 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 SPG7Q9UQ90 795 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 M0R082 166 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 GIPC1O14908 333 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 LILRB5O75023 590 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 TRPA1O75762 1119 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ARHGEF15O94989 841 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 GNA15P30679 374 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 DAB2P98082 770 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 GRM2Q14416 872 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 CEP135Q66GS9 1140 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 CCNJLQ8IV13 435 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ZNF417Q8TAU3 575 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 NXPE3Q969Y0 559 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 HHIPQ96QV1 700 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 TCF12Q99081 682 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 BCO2Q9BYV7 579 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 BCL11AQ9H165 835 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 LIN7BQ9HAP6 207 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 RNF19AQ9NV58 838 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 TRAK1Q9UPV9 953 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ITGAEP38570 1179 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 DGKGP49619 791 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 PSMD2Q13200 908 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 GRIK5Q16478 980 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 TMC4Q7Z404 712 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 RRAGCQ9HB90 399 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 AK5Q9Y6K8 562 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 FAM177BA6PVY3 158 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 SORBS3O60504 671 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 PTPRAP18433 802 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 CDC27P30260 824 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 BSNDQ8WZ55 320 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ZNF428Q96B54 188 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 FAM161BQ96MY7 647 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ADAM19Q9H013 955 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 C12orf49Q9H741 205 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 MRS2Q9HD23 443 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 A0A096LPE4 126 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 A0A1W2PPZ6 126 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 METTL12A8MUP2 240 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 GSTT1P30711 240 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 BAG6P46379 1132 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 GRIA4P48058 902 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 FCGRTP55899 365 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 WFDC8Q8IUA0 241 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 IL22RA1Q8N6P7 574 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 MUC3BQ9H195 1237 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 ABCB6Q9NP58 842 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 FAM8A1Q9UBU6 413 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 SOX13Q9UN79 622 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS3-208ENST00000567432 UNCXA6NJT0 531 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 PIK3R2O00459 728 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 USP17L7P0C7H9 530 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 NID1P14543 1247 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 ITPKAP23677 461 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 CABP4P57796 275 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 MSL1Q68DK7 614 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 PODNQ7Z5L7 613 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS3-208ENST00000567432 MKL2Q9ULH7 1088 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms