RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 CREBZFQ9NS37 354 aa26.83■■□□□ 1.89
RNPS1-218ENST00000566180 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.82■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF609O15014 1411 aa26.81■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.8■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 GMLQ99445 158 aa26.8■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.8■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 PLIN1O60240 522 aa26.79■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.79■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 SPEF2Q9C093 1822 aa26.79■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.78■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 EGFRP00533 1210 aa26.78■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 TRIM27P14373 513 aa26.78■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 DACT2Q5SW24 774 aa26.78■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.78■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 CD209Q9NNX6 404 aa26.78■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.77■■□□□ 1.88
RNPS1-218ENST00000566180 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.76■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 UBE4AQ14139 1066 aa26.76■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 SCN9AQ15858 1988 aa26.75■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 USP17L8P0C7I0 530 aa26.75■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC24Q50LG9 513 aa26.75■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 MEIS3Q99687 375 aa26.75■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 TRAF5O00463 557 aa26.74■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.74■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.74■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 JMYQ8N9B5 988 aa26.74■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.74■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 TNNQ9UQP3 1299 aa26.74■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 FBXW7Q969H0 707 aa26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 MXD3Q9BW11 206 aa26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 IL1R1P14778 569 aa26.72■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 GTF2IP78347 998 aa26.72■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.72■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 GNAI3P08754 354 aa26.71■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 METTL24Q5JXM2 366 aa26.71■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.71■■□□□ 1.87
RNPS1-218ENST00000566180 CST9Q5W186 159 aa26.7■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.7■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.7■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 EYA2O00167 538 aa26.69■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 PDE8BO95263 885 aa26.69■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 MMP14P50281 582 aa26.69■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 USP48Q86UV5 1035 aa26.68■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 OGFOD1Q8N543 542 aa26.68■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 CNTNAP1P78357 1384 aa26.68■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 SCARF1Q14162 830 aa26.67■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 FBXO3Q9UK99 471 aa26.67■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 RASSF10A6NK89 507 aa26.66■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 SASH1O94885 1247 aa26.66■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 GYG1P46976 350 aa26.66■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.66■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 GGA3Q9NZ52 723 aa26.66■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.65■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 CERS5Q8N5B7 392 aa26.65■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.65■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 CIAO1O76071 339 aa26.64■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 CELF2O95319 508 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.64■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.64■■□□□ 1.86
RNPS1-218ENST00000566180 PSME4Q14997 1843 aa26.64■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 FGFR2P21802 821 aa26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 MTX1Q13505 466 aa26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 COPRSQ9NQ92 184 aa26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1B0GUL6 1792 aa26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 DLK2Q6UY11 383 aa26.62■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 SULF1Q8IWU6 871 aa26.62■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 SIL1Q9H173 461 aa26.62■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.62■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 ADM5C9JUS6 153 aa26.61■■□□□ 1.85
RNPS1-218ENST00000566180 GNAI2P04899 355 aa26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms