RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 USP17L1Q7RTZ2 530 aa38.61■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 SAMD7Q7Z3H4 446 aa38.61■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 FBXW7Q969H0 707 aa38.61■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 KLRG1Q96E93 195 aa38.6■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 CREBZFQ9NS37 354 aa38.6■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
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CMTM4-204ENST00000563952 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
CMTM4-204ENST00000563952 AGBL3Q8NEM8 1001 aa38.57■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM88BA6NKF7 163 aa38.55■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 EGFRP00533 1210 aa38.55■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF609O15014 1411 aa38.54■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 TRAF5O00463 557 aa38.53■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 TRIM27P14373 513 aa38.53■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP38.53■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 KLHDC4Q8TBB5 520 aa38.53■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 MXD3Q9BW11 206 aa38.53■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 PGAP2Q9UHJ9 254 aa38.53■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 IRS2Q9Y4H2 1338 aa38.53■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa38.52■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa38.52■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 TNNQ9UQP3 1299 aa38.52■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa38.52■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC24Q50LG9 513 aa38.51■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 DACT2Q5SW24 774 aa38.51■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 STRIP1Q5VSL9 837 aa38.51■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 GMLQ99445 158 aa38.51■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 CD209Q9NNX6 404 aa38.51■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 MROH5Q6ZUA9 1318 aa38.51■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF804AQ7Z570 1209 aa38.5■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 MEIS3Q99687 375 aa38.5■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 USP17L8P0C7I0 530 aa38.49■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 TTLL5Q6EMB2 1281 aa38.49■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 CLUAP1Q96AJ1 413 aa38.49■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 GTF2IP78347 998 aa38.48■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 METTL24Q5JXM2 366 aa38.48■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 HDAC5Q9UQL6 1122 aa38.48■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 UBE4AQ14139 1066 aa38.47■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 TRPM7Q96QT4 1865 aa38.46■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 MYO3BQ8WXR4 1341 aa38.45■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa38.45■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 CDC37L1Q7L3B6 337 aa38.45■■■■□ 3.75
CMTM4-204ENST00000563952 MYOZ2Q9NPC6 264 aa38.44■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 USP48Q86UV5 1035 aa38.43■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
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CMTM4-204ENST00000563952 IL1R1P14778 569 aa38.42■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 JMYQ8N9B5 988 aa38.42■■■■□ 3.74
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CMTM4-204ENST00000563952 OGFOD1Q8N543 542 aa38.41■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 CST9Q5W186 159 aa38.4■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 KRT26Q7Z3Y9 468 aa38.4■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 GGA3Q9NZ52 723 aa38.4■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 CNTNAP1P78357 1384 aa38.4■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 EYA2O00167 538 aa38.39■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 PDE8BO95263 885 aa38.39■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 CELF2O95319 508 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
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CMTM4-204ENST00000563952 KIAA0825Q8IV33 1275 aa38.39■■■■□ 3.74
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF408Q9H9D4 720 aa38.39■■■■□ 3.74
CMTM4-204ENST00000563952 SIL1Q9H173 461 aa38.38■■■■□ 3.73
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CMTM4-204ENST00000563952 TMEM57Q8N5G2 664 aa38.37■■■■□ 3.73
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CMTM4-204ENST00000563952 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.72
CMTM4-204ENST00000563952 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.72
CMTM4-204ENST00000563952 SASH1O94885 1247 aa38.31■■■■□ 3.72
CMTM4-204ENST00000563952 VEGFBP49765 207 aa38.31■■■■□ 3.72
CMTM4-204ENST00000563952 NBPF9Q3BBW0 867 aa38.31■■■■□ 3.72
CMTM4-204ENST00000563952 CAVIN4Q5BKX8 364 aa38.31■■■■□ 3.72
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