RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560350.5

USP3-AS1-206, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 407 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-206ENST00000560350 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 RPS6KA4O75676 772 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 ERBB4Q15303 1308 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-206ENST00000560350 ITPK1Q13572 414 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 NR6A1Q15406 480 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 ARXQ96QS3 562 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 MAP3K5Q99683 1374 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 BTBD11A6QL63 1104 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 STARD3NLO95772 234 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF790Q6PG37 636 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 SBF2Q86WG5 1849 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 RFC4P35249 363 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 NFE2L2Q16236 605 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 RREB1Q92766 1687 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 ANP32CO43423 234 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 BMP2P12643 396 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 SYT17Q9BSW7 474 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 A0A087WZG4 1122 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 MAN1A2O60476 641 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 AP1G2O75843 785 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 UPP2O95045 317 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 VSIG8P0DPA2 414 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLC39A6Q13433 755 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 RIPK4P57078 832 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 RUNDC1Q96C34 613 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.91□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 MCM10Q7L590 875 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 BTAF1O14981 1849 aa9.9□□□□□ -0.82
USP3-AS1-206ENST00000560350 LRP5O75197 1615 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 Q6ZVU0 165 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZBTB33Q86T24 672 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.89□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 USP17L8P0C7I0 530 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 PTK2Q05397 1052 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 DCTN1Q14203 1278 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 NARFQ9UHQ1 456 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 PAPPAQ13219 1627 aa9.88□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 MRC1P22897 1456 aa9.87□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 GYS1P13807 737 aa9.87□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 CBLBQ13191 982 aa9.87□□□□□ -0.83
USP3-AS1-206ENST00000560350 MSL1Q68DK7 614 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms