RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 PEAK1Q9H792 1746 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 A6NJY4 79 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 BACH1O14867 736 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 F11P03951 625 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 ATP4AP20648 1035 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 HOMEZQ8IX15 550 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 GMCL1Q96IK5 515 aa6.03□□□□□ -1.44
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TMOD3-204ENST00000558666 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD3-204ENST00000558666 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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TMOD3-204ENST00000558666 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.02□□□□□ -1.45
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TMOD3-204ENST00000558666 H7C1W4 665 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CDK2AP1O14519 115 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 THBS1P07996 1170 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 FOXK2Q01167 660 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 GAS6Q14393 721 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 DBN1Q16643 649 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC102BQ68D86 513 aa6.02□□□□□ -1.45
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TMOD3-204ENST00000558666 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 SLIT3O75094 1523 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGEF10O15013 1369 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CD163L1Q9NR16 1453 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 EVC2Q86UK5 1308 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 NFAT5O94916 1531 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 DKK1O94907 266 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 RASA1P20936 1047 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CHRNA2Q15822 529 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 USP21Q9UK80 565 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 SBNO1A3KN83 1393 aa6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 EP400Q96L91 3159 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 SLIT2O94813 1529 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L15C9J2P7 530 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L10C9JJH3 530 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L13C9JLJ4 530 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L12C9JPN9 530 aa6□□□□□ -1.45
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TMOD3-204ENST00000558666 M0R2N6 131 aa6□□□□□ -1.45
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TMOD3-204ENST00000558666 MSX1P28360 303 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L24Q0WX57 530 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 C1orf216Q8TAB5 229 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CRISPLD1Q9H336 500 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 RUBCNLQ9H714 662 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 CABP1Q9NZU7 370 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 STK17AQ9UEE5 414 aa6□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PP64 1363 aa6□□□□□ -1.45
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TMOD3-204ENST00000558666 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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TMOD3-204ENST00000558666 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 STRN4Q9NRL3 753 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 USP35Q9P2H5 1018 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 BTAF1O14981 1849 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 ITGB4P16144 1822 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.99□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 RREB1Q92766 1687 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD3-204ENST00000558666 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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