RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 HAUS7Q99871 368 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 FSD1Q9BTV5 496 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 PANK2Q9BZ23 570 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 SNRKQ9NRH2 765 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 AFF2P51816 1311 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ITGA6P23229 1130 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
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CS-204ENST00000546621 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.29□□□□□ -0.92
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CS-204ENST00000546621 GREM2Q9H772 168 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 LRP5O75197 1615 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GUL7 405 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 VGLL3A8MV65 326 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 MCM2P49736 904 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 NEK4P51957 841 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 TIMM10P62072 90 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 SUSD4Q5VX71 490 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.28□□□□□ -0.92
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CS-204ENST00000546621 FAM227BQ96M60 508 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 MED23Q9ULK4 1368 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 LAMB2P55268 1798 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-204ENST00000546621 SCN7AQ01118 1682 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 A0A0D9SFI3 127 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PSEN1P49768 467 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CNPY4Q8N129 248 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SPEF2Q9C093 1822 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SBF2Q86WG5 1849 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 POTEB2H3BUK9 544 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 UQCRHP07919 91 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PTH1RQ03431 593 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 METTL24Q5JXM2 366 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TICAM2Q86XR7 235 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 KCNB2Q92953 911 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 OTUD5Q96G74 571 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 LY75O60449 1722 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ABCC12Q96J65 1359 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RGL2O15211 777 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 NTSR2O95665 410 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 MCM5P33992 734 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 KCNQ4P56696 695 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ATP2B3Q16720 1220 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CEP120Q8N960 986 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 XAGE2Q96GT9 111 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RTL9Q8NET4 1388 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 FAM177BA6PVY3 158 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 GOLIM4O00461 696 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ADORA1P30542 326 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 NECTIN1Q15223 517 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 FAM182BQ5T319 152 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 GORABQ5T7V8 394 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.25□□□□□ -0.93
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