RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 DSCC1Q9BVC3 393 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 C5P01031 1676 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 MYO1BO43795 1136 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 YEATS4O95619 227 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TPM1P09493 284 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 PROSER3Q2NL68 480 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TNNI3KQ59H18 835 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 DDX11Q96FC9 970 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 HELLSQ9NRZ9 838 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.446e-6■□□□□ 9.1
CS-202ENST00000542324 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 PXDNQ92626 1479 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 IGSF3O75054 1194 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 CTDNEP1O95476 244 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 ME1P48163 572 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 FGD1P98174 961 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 FCHSD1Q86WN1 690 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 KCNG4Q8TDN1 519 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TIGD1Q96MW7 591 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 NEURL1BA8MQ27 555 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 IKBKBO14920 756 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 NLRP12P59046 1061 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 KBTBD3Q8NAB2 608 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 IGKV5-2P06315 115 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 EVCP57679 992 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 GCKRQ14397 625 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 STOX1Q6ZVD7 989 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 ZNF446Q9NWS9 450 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 CBFA2T2O43439 604 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 ETF1P62495 437 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 SLC20A2Q08357 652 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 ARMCX5Q6P1M9 558 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 BRAPQ7Z569 592 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 SDF4Q9BRK5 362 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 SIL1Q9H173 461 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 POLR3EQ9NVU0 708 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 PCDHA7Q9UN72 937 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 CYP2C19P33261 490 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 PDIA6Q15084 440 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 TMC6Q7Z403 805 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 LINC00301Q8NCQ3 95 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 TSPYL1Q9H0U9 437 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 FHOD1Q9Y613 1164 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 KIF1AQ12756 1690 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 TMEM94Q12767 1356 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 SMC2O95347 1197 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 CLCN6P51797 869 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 PSME1Q06323 249 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 SYT10Q6XYQ8 523 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 GPR108Q9NPR9 543 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 IFNKQ9P0W0 207 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 DNAI1Q9UI46 699 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 V9GYY5 206 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 NEDD4P46934 1319 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 APOBRQ0VD83 1088 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 STK38Q15208 465 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 TEX35Q5T0J7 233 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 TFCP2Q12800 502 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 NCAPHQ15003 741 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 DPCR1Q3MIW9 517 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 CCDC158Q5M9N0 1113 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 TMCO3Q6UWJ1 677 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-202ENST00000542324 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.23□□□□□ -0.45
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