RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	GML	Q99445	158 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	FOXO4	P98177	505 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	AIDA	Q96BJ3	306 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	CCER2	I3L3R5	266 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	PLIN1	O60240	522 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	TAF5L	O75529	589 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	CHRND	Q07001	517 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	AOC2	O75106	756 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	MAP2K2	P36507	400 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	LBX1	P52954	281 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	SCARF1	Q14162	830 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	PTPRC	P08575	1304 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	SNAP23	O00161	211 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	KLRK1	P26718	216 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	HUNK	P57058	714 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	GTF2I	P78347	998 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	CAPN15	O75808	1086 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	LAMB1	P07942	1786 aa		11.33	□□□□□ -0.59
LMO3-222	ENST00000540445	NOG	Q13253	232 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	UTY	O14607	1347 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	MMP14	P50281	582 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LMO3-222	ENST00000540445	WNT10B	O00744	389 aa		11.31	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms