RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533459.1

AP002989.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP002989.1, Length 562 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002989.1-201ENST00000533459 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.01□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 SLIT1O75093 1534 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 SPINT1O43278 529 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ATF3P18847 181 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 RXRBP28702 533 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 RTN1Q16799 776 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF280CQ8ND82 737 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 FBF1Q8TES7 1133 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 CRELD1Q96HD1 420 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 PIF1Q9H611 641 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 POLIQ9UNA4 740 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 NCOA2Q15596 1464 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ARHGEF5Q12774 1597 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 TIAM1Q13009 1591 aa6□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 MYOM3Q5VTT5 1437 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ABCC3O15438 1527 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ALKQ9UM73 1620 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 A6NHS1 94 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 BMP1P13497 986 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ATP2B2Q01814 1243 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 IDI1Q13907 227 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 RNF217Q8TC41 542 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 FRMD6Q96NE9 622 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 SLC26A8Q96RN1 970 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 AK5Q9Y6K8 562 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.99□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 PDGFAP04085 211 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ATP4AP20648 1035 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ZAP70P43403 619 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 AAMPQ13685 434 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 SDE2Q6IQ49 451 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ABTB2Q8N961 1025 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 EDEM1Q92611 657 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 IFT43Q96FT9 208 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 NIF3L1Q9GZT8 377 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 USP20Q9Y2K6 914 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ERBINQ96RT1 1412 aa5.98□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 FGRP09769 529 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 RHOQP17081 205 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ARID5AQ03989 594 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 POU4F2Q12837 409 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 SOGA3Q5TF21 947 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 TREML1Q86YW5 311 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 TMC1Q8TDI8 760 aa5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.96□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 KIF15Q9NS87 1388 aa5.96□□□□□ -1.45
AP002989.1-201ENST00000533459 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 EFCAB6Q5THR3 1501 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 BMP2P12643 396 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GPC1P35052 558 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GJA8P48165 433 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GNASQ5JWF2 1037 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 GPR152Q8TDT2 470 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 AIDAQ96BJ3 306 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 CSRNP1Q96S65 589 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.96□□□□□ -1.46
AP002989.1-201ENST00000533459 PIK3R4Q99570 1358 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms