RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC24Q50LG9 513 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 FBXW7Q969H0 707 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 CNTROBQ8N137 903 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 PASKQ96RG2 1323 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 H7C1D1 291 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 PODNQ7Z5L7 613 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 DPF2Q92785 391 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 COA1Q9GZY4 146 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L3A6NCW0 530 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L4A6NCW7 530 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 TRAF5O00463 557 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 METTL24Q5JXM2 366 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 DACT2Q5SW24 774 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 GMLQ99445 158 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 CD209Q9NNX6 404 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF609O15014 1411 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 SIL1Q9H173 461 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 JAG2Q9Y219 1238 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-211ENST00000531385 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 RLBP1P12271 317 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 GTF2IP78347 998 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 GYG1P46976 350 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 DLK2Q6UY11 383 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 UBE4AQ14139 1066 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 KLRG1Q96E93 195 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 CREBZFQ9NS37 354 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 EYA2O00167 538 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 GNAI3P08754 354 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L8P0C7I0 530 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 PCNTO95613 3336 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 PDE8BO95263 885 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 IL1R1P14778 569 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 CERS5Q8N5B7 392 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 GGA3Q9NZ52 723 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-211ENST00000531385 USP48Q86UV5 1035 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 ADM5C9JUS6 153 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 SRGAP3O43295 1099 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 PANK1Q8TE04 598 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 F8W031 263 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 SASH1O94885 1247 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 GNAI2P04899 355 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 SCARF1Q14162 830 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 CST9Q5W186 159 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 FGFR2P21802 821 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 CIAO1O76071 339 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRU-211ENST00000531385 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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