RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 DOCK2Q92608 1830 aa9□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 SBF2Q86WG5 1849 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 KCNJ4P48050 445 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 AK2P54819 239 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 EVCP57679 992 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 MTA3Q9BTC8 594 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 NYXQ9GZU5 481 aa8.99□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 BTAF1O14981 1849 aa8.98□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.98□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 METTL24Q5JXM2 366 aa8.98□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.98□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 KIF3AQ9Y496 699 aa8.98□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 SLC5A1P13866 664 aa8.97□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 ZNF445P59923 1031 aa8.97□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 ITPK1Q13572 414 aa8.97□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 GORABQ5T7V8 394 aa8.97□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 SUSD4Q5VX71 490 aa8.97□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 GREM2Q9H772 168 aa8.97□□□□□ -0.97
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PACS1-211ENST00000531298 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.97□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 NARFQ9UHQ1 456 aa8.97□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.97□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 A0A1B0GUL6 1792 aa8.96□□□□□ -0.97
PACS1-211ENST00000531298 GOLIM4O00461 696 aa8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SEMA3EO15041 775 aa8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
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PACS1-211ENST00000531298 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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PACS1-211ENST00000531298 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 BCL11AQ9H165 835 aa8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 USP21Q9UK80 565 aa8.96□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 STX6O43752 255 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CYP21A2P08686 494 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GNAT2P19087 354 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ADD2P35612 726 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 MAST3O60307 1309 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ELP1O95163 1332 aa8.95□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PFKFB2O60825 505 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PHF14O94880 888 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GPTP24298 496 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 RCAN1P53805 252 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 ME3Q16798 604 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CCDC102BQ68D86 513 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 CERKQ8TCT0 537 aa8.94□□□□□ -0.98
PACS1-211ENST00000531298 GTF3C6Q969F1 213 aa8.94□□□□□ -0.98
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