RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.61■■□□□ 1.37
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TSTA3-211ENST00000529899 KCNJ4P48050 445 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-211ENST00000529899 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-211ENST00000529899 LRRC24Q50LG9 513 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-211ENST00000529899 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-211ENST00000529899 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-211ENST00000529899 DLK2Q6UY11 383 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-211ENST00000529899 FBXW7Q969H0 707 aa23.59■■□□□ 1.37
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TSTA3-211ENST00000529899 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TSTA3-211ENST00000529899 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
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TSTA3-211ENST00000529899 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.57■■□□□ 1.36
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TSTA3-211ENST00000529899 USP17L4A6NCW7 530 aa23.56■■□□□ 1.36
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TSTA3-211ENST00000529899 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-211ENST00000529899 PODNQ7Z5L7 613 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.56■■□□□ 1.36
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TSTA3-211ENST00000529899 KLRG1Q96E93 195 aa23.55■■□□□ 1.36
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TSTA3-211ENST00000529899 ZNF609O15014 1411 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-211ENST00000529899 CD209Q9NNX6 404 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-211ENST00000529899 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-211ENST00000529899 CREBZFQ9NS37 354 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-211ENST00000529899 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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TSTA3-211ENST00000529899 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-211ENST00000529899 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-211ENST00000529899 GYG1P46976 350 aa23.51■■□□□ 1.35
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TSTA3-211ENST00000529899 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.5■■□□□ 1.35
TSTA3-211ENST00000529899 CERS5Q8N5B7 392 aa23.5■■□□□ 1.35
TSTA3-211ENST00000529899 SIL1Q9H173 461 aa23.5■■□□□ 1.35
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TSTA3-211ENST00000529899 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.48■■□□□ 1.35
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TSTA3-211ENST00000529899 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.47■■□□□ 1.35
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TSTA3-211ENST00000529899 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TSTA3-211ENST00000529899 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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TSTA3-211ENST00000529899 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.46■■□□□ 1.35
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TSTA3-211ENST00000529899 PDE8BO95263 885 aa23.45■■□□□ 1.34
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TSTA3-211ENST00000529899 FGFR2P21802 821 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 AOX1Q06278 1338 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 PANK1Q8TE04 598 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-211ENST00000529899 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.41■■□□□ 1.34
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