RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 FLIIQ13045 1269 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRJ-205ENST00000527952 TXNRD3Q86VQ6 643 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRJ-205ENST00000527952 MCOLN1Q9GZU1 580 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRJ-205ENST00000527952 GCKRQ14397 625 aa30.76■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 MED23Q9ULK4 1368 aa30.76■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM161AQ3B820 660 aa30.75■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.75■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC102AQ96A19 550 aa30.75■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 MRS2Q9HD23 443 aa30.75■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF609O15014 1411 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 ITGA6P23229 1130 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 KLRK1P26718 216 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 DGKZQ13574 1117 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 MOB2Q70IA6 237 aa30.74■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 DACT2Q5SW24 774 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 IL16Q14005 1332 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC10A3P09131 477 aa30.72■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 CASP7P55210 303 aa30.72■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 TRPA1O75762 1119 aa30.71■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 AKAP11Q9UKA4 1901 aa30.71■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 CSRNP1Q96S65 589 aa30.7■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 COA1Q9GZY4 146 aa30.7■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF186Q9NXI6 227 aa30.7■■■□□ 2.51
PTPRJ-205ENST00000527952 VAMP4O75379 141 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 SNAP23O00161 211 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 RASAL3Q86YV0 1011 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 MYH16Q9H6N6 1097 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 UBE2Q2LH0YL09 131 aa30.67■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 SASH1O94885 1247 aa30.67■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 CSF1RP07333 972 aa30.67■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 LINS1Q8NG48 757 aa30.67■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.67■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 CACNA1FO60840 1977 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 F6X3S4 739 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 STRIP1Q5VSL9 837 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 WNT10BO00744 389 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 CHRNDQ07001 517 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 TTLL5Q6EMB2 1281 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 OGFOD1Q8N543 542 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNJ4P48050 445 aa30.64■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 GTF2IP78347 998 aa30.64■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA0825Q8IV33 1275 aa30.64■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.64■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.64■■■□□ 2.5
PTPRJ-205ENST00000527952 TAF5LO75529 589 aa30.63■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR63Q8IWG1 891 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MYO3BQ8WXR4 1341 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 ANP32CO43423 234 aa30.61■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 FKBP1BP68106 108 aa30.61■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXO4P98177 505 aa30.6■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 PRKG1Q13976 671 aa30.6■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CD209Q9NNX6 404 aa30.59■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 BEND3Q5T5X7 828 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1B0GUL6 1792 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRJ-205ENST00000527952 RGS19P49795 217 aa30.57■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 EPHA10Q5JZY3 1008 aa30.57■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 HDAC9Q9UKV0 1011 aa30.56■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 IRS2Q9Y4H2 1338 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 PLIN1O60240 522 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 LMBR1LQ6UX01 489 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 CERS5Q8N5B7 392 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 FZD1Q9UP38 647 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 JAG2Q9Y219 1238 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 F8W031 263 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 NF2P35240 595 aa30.53■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D8O95759 1140 aa30.52■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.51■■■□□ 2.47
PTPRJ-205ENST00000527952 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
PTPRJ-205ENST00000527952 DLGAP5Q15398 846 aa30.5■■■□□ 2.47
PTPRJ-205ENST00000527952 TAF7LQ5H9L4 462 aa30.5■■■□□ 2.47
PTPRJ-205ENST00000527952 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
PTPRJ-205ENST00000527952 GRM8O00222 908 aa30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms