RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522585.1

MRPS27-215, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S27, human

TSL 3

Gene MRPS27, Length 127 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS27-215	ENST00000522585	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	PAOX	Q6QHF9	649 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	ZAR1	Q86SH2	424 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	ZNF843	Q8N446	348 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	ZNF366	Q8N895	744 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	RXRB	P28702	533 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	ACAD11	Q709F0	780 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	0.37	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	USP40	Q9NVE5	1235 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	HOXA2	O43364	376 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	KCNAB3	O43448	404 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	KRT86	O43790	486 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	PEX10	O60683	326 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	PI3	P19957	117 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	MCM7	P33993	719 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	KCNC1	P48547	511 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	GDF10	P55107	478 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	MVK	Q03426	396 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	KRT81	Q14533	505 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	C4orf17	Q53FE4	359 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	FBXL22	Q6P050	247 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	LGR6	Q9HBX8	967 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585		A0A1W2PNR3	127 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	FAM170B	A6NMN3	283 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	C6orf229	H3BNL8	230 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	ZFPL1	O95159	310 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	AZU1	P20160	251 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	SSPN	Q14714	243 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	NFKBIB	Q15653	356 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	FERMT3	Q86UX7	667 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	TTC9	Q92623	222 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	HLA-C	Q95604	372 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	IRAK3	Q9Y616	596 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MRPS27-215	ENST00000522585	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	SOCS7	O14512	581 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	CCKBR	P32239	447 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	PREP	P48147	710 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	SPEM2	Q0P670	501 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	PTGDR	Q13258	359 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	PTK7	Q13308	1070 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	CDSN	Q15517	529 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	PCSK7	Q16549	785 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	COLEC12	Q5KU26	742 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	CYLD	Q9NQC7	956 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	MAP10	Q9P2G4	905 aa		0.34	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	ZNF202	O95125	648 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	TNFRSF1B	P20333	461 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	MT3	P25713	68 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	CD38	P28907	300 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	AOC3	Q16853	763 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	VMAC	Q2NL98	169 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	SHISA5	Q8N114	240 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	AGAP2	Q99490	1192 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	SLC30A3	Q99726	388 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	NAGPA	Q9UK23	515 aa		0.33	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		0.32	□□□□□ -2.36
MRPS27-215	ENST00000522585	ATP4A	P20648	1035 aa		0.32	□□□□□ -2.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms