RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514889.1

RASGEF1B-212, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 648 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-212ENST00000514889 GRIN3BO60391 1043 aa13.55□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 KCNC4Q03721 635 aa13.55□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 QPCTQ16769 361 aa13.55□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 ERBB4Q15303 1308 aa13.55□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 BRICD5Q6PL45 260 aa13.54□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.54□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 THAP11Q96EK4 314 aa13.54□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa13.54□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 NUP98P52948 1817 aa13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 NKX2-3Q8TAU0 364 aa13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 SETDB2Q96T68 719 aa13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 ZBTB3Q9H5J0 574 aa13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 IFT57Q9NWB7 429 aa13.53□□□□□ -0.24
RASGEF1B-212ENST00000514889 MTMR2Q13614 643 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 C2CD5Q86YS7 1000 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 WWC1Q8IX03 1113 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 CNBD1Q8NA66 436 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 SPSB2Q99619 263 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 PIM2Q9P1W9 311 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ADCY9O60503 1353 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ATP10DQ9P241 1426 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ABCC12Q96J65 1359 aa13.51□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.51□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 LILRB3O75022 631 aa13.51□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 CCDC27Q2M243 656 aa13.51□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.51□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 CHPF2Q9P2E5 772 aa13.51□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ZNF652Q9Y2D9 606 aa13.51□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 FAM177BA6PVY3 158 aa13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 KIF6Q6ZMV9 814 aa13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 C8orf58Q8NAV2 365 aa13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 XAGE3Q8WTP9 111 aa13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 BRIP1Q9BX63 1249 aa13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 HOXB7P09629 217 aa13.49□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 GPTP24298 496 aa13.49□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 GNAI1P63096 354 aa13.49□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 COPS6Q7L5N1 327 aa13.49□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 TSPYL6Q8N831 410 aa13.49□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 SUSD4Q5VX71 490 aa13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 H0YIN7 160 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ADH1BP00325 375 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 PRELPP51888 382 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ST5P78524 1137 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 RETREG3Q86VR2 466 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 CACNA1SQ13698 1873 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 SLX4Q8IY92 1834 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 NTSR2O95665 410 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 SRGNP10124 158 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 PDE6BP35913 854 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 RASSF7Q02833 373 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ERFEQ4G0M1 354 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 TTLL6Q8N841 843 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-212ENST00000514889 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 IL16Q14005 1332 aa13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 NPHP1O15259 732 aa13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 TPTE2Q6XPS3 522 aa13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 PRR7Q8TB68 274 aa13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.44□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.44□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 CFAP99D6REC4 459 aa13.44□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 NFKBIEO00221 500 aa13.44□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 SLC51AQ86UW1 340 aa13.44□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 ZNF428Q96B54 188 aa13.44□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 PRDM9Q9NQV7 894 aa13.44□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 SBF1O95248 1867 aa13.43□□□□□ -0.26
RASGEF1B-212ENST00000514889 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms