RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513333.1

EPB41L4A-208, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A, human

TSL 5

Gene EPB41L4A, Length 333 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FGFR3	P22607	806 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	VEGFB	P49765	207 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KCNQ4	P56696	695 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LAMC2	Q13753	1193 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DBN1	Q16643	649 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TMEM74	Q96NL1	305 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	HHIP	Q96QV1	700 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LNPK	Q9C0E8	428 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CBX8	Q9HC52	389 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ABCB6	Q9NP58	842 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333		A0A096LPE4	126 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333		A0A1W2PPZ6	126 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SLC35F4	A4IF30	521 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	THBS1	P07996	1170 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BMP4	P12644	408 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CPB1	P15086	417 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ITGA6	P23229	1130 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MCM4	P33991	863 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SOX18	P35713	384 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GRIA4	P48058	902 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GJA8	P48165	433 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LIG3	P49916	1009 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NRL	P54845	237 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SIK1	P57059	783 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ATP11A	P98196	1134 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	APOBR	Q0VD83	1088 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SOGA3	Q5TF21	947 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CEP135	Q66GS9	1140 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SV2B	Q7L1I2	683 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SYT9	Q86SS6	491 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FAM35A	Q86V20	835 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CCNJL	Q8IV13	435 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KIFC2	Q96AC6	838 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPATA32	Q96LK8	384 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TCF12	Q99081	682 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SENP2	Q9HC62	589 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DACH1	Q9UI36	760 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SAMM50	Q9Y512	469 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KIF4A	O95239	1232 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MAP3K6	O95382	1288 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BPNT1	O95861	308 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PF4	P02776	101 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FGR	P09769	529 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CDC25B	P30305	580 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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