RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SCARF1Q14162 830 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 NOGQ13253 232 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 LINS1Q8NG48 757 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 SPEF2Q9C093 1822 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 PSME4Q14997 1843 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 CA12O43570 354 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 ITGA6P23229 1130 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 FAM161AQ3B820 660 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 RGMBQ6NW40 437 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.6■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 CSF1RP07333 972 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 CDCA5Q96FF9 252 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 ABHD8Q96I13 439 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 MXD3Q9BW11 206 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HERC3-211ENST00000513325 DACT2Q5SW24 774 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 FBXW7Q969H0 707 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 COA1Q9GZY4 146 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 F6X3S4 739 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 KLRK1P26718 216 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 CCDC102AQ96A19 550 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 CACNA1FO60840 1977 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 CHRNDQ07001 517 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 BEND3Q5T5X7 828 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 OGFOD1Q8N543 542 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ4P48050 445 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 FOXO4P98177 505 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 SNAP23O00161 211 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 WNT10BO00744 389 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC10A3P09131 477 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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HERC3-211ENST00000513325 GTF2IP78347 998 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.5■■□□□ 1.03
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HERC3-211ENST00000513325 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 SASH1O94885 1247 aa21.49■■□□□ 1.03
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HERC3-211ENST00000513325 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 CD209Q9NNX6 404 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 GRM8O00222 908 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 MOB2Q70IA6 237 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 CSRNP1Q96S65 589 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 RNF186Q9NXI6 227 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 MMP14P50281 582 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 TRPA1O75762 1119 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 DGKZQ13574 1117 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HERC3-211ENST00000513325 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 ALDH1L1O75891 902 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 CERS5Q8N5B7 392 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 PLIN1O60240 522 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 IL1R1P14778 569 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 NF2P35240 595 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 ZNF521Q96K83 1311 aa21.42■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GUL6 1792 aa21.41■■□□□ 1.02
HERC3-211ENST00000513325 DLGAP5Q15398 846 aa21.41■■□□□ 1.02
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