RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 ABTB2Q8N961 1025 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 PIK3R4Q99570 1358 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 MYOM2P54296 1465 aa10.08□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 GFRA3O60609 400 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 MPSTP25325 297 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 PLA2G4AP47712 749 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 ATRNO75882 1429 aa10.07□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 TTLL8A6PVC2 850 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 LAPTM4AQ15012 233 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 HIF1AQ16665 826 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.06□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 AXIN1O15169 862 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 TXLNAP40222 546 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 POU4F2Q12837 409 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 GLI3P10071 1580 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 ADAMTS2O95450 1211 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 MAPK1P28482 360 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 DGKZQ13574 1117 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 AIDAQ96BJ3 306 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 BMP1P13497 986 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 PHKA2P46019 1235 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 CITED4Q96RK1 184 aa10.03□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 METP08581 1390 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 USP47Q96K76 1375 aa10.02□□□□□ -0.8
HERC3-210ENST00000512194 NDUFB5O43674 189 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 IFT43Q96FT9 208 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ZFP42Q96MM3 310 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ASB16Q96NS5 453 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.02□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 PIK3C2GO75747 1445 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GTH6 734 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 RBCK1Q9BYM8 510 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 KLK14Q9P0G3 267 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 USP21Q9UK80 565 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.01□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 PTCH1Q13635 1447 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 AAMPQ13685 434 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 PPLO60437 1756 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 FZD6O60353 706 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB39O15060 712 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ATP4AP20648 1035 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 TMF1P82094 1093 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 FAM26DQ5JW98 314 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 IER5Q5VY09 327 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 IFT172Q9UG01 1749 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ABCA3Q99758 1704 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 RHOQP17081 205 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 MSX1P28360 303 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 ZAP70P43403 619 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 COL19A1Q14993 1142 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-210ENST00000512194 SUSD3Q96L08 255 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms