RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 PKP1Q13835 747 aa12.94□□□□□ -0.34
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SH3BP2-209ENST00000504450 METTL24Q5JXM2 366 aa12.94□□□□□ -0.34
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SH3BP2-209ENST00000504450 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
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SH3BP2-209ENST00000504450 RNF20Q5VTR2 975 aa12.93□□□□□ -0.34
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SH3BP2-209ENST00000504450 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa12.93□□□□□ -0.34
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SH3BP2-209ENST00000504450 SCARF1Q14162 830 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC39AQ5SRH9 613 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 DSCC1Q9BVC3 393 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 CNNM1Q9NRU3 951 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 TAF6LQ9Y6J9 622 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 MROH5Q6ZUA9 1318 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS6KA4O75676 772 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS6KB1P23443 525 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 SLFNL1Q499Z3 407 aa12.91□□□□□ -0.34
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SH3BP2-209ENST00000504450 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF652Q9Y2D9 606 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 MYH3P11055 1940 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 BCORQ6W2J9 1755 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 ZAP70P43403 619 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 ST3GAL1Q11201 340 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT32Q14532 448 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 GORABQ5T7V8 394 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-209ENST00000504450 MAST3O60307 1309 aa12.89□□□□□ -0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 PHF14O94880 888 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 LARGE1O95461 756 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP21A2P08686 494 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 LPIN2Q92539 896 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 OSBP2Q969R2 916 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC31BQ9NQW1 1179 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 NARFQ9UHQ1 456 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 M0R2C6 588 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 MCAMP43121 646 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 ME3Q16798 604 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM5Q71RC9 77 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 NEK1Q96PY6 1258 aa12.88□□□□□ -0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 LMBRD1Q9NUN5 540 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMB2P55268 1798 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 FSD2A1L4K1 749 aa12.87□□□□□ -0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 GOLGA6L22H0YM25 854 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXP2O15409 715 aa12.87□□□□□ -0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD1Q15327 319 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC102BQ68D86 513 aa12.87□□□□□ -0.35
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SH3BP2-209ENST00000504450 LY75O60449 1722 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 GRIN3BO60391 1043 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 PHKA1P46020 1223 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 ERFEQ4G0M1 354 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 PI16Q6UXB8 463 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 UTRNP46939 3433 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 AKAP11Q9UKA4 1901 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
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