RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 USP17L3A6NCW0 530 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 USP17L4A6NCW7 530 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXD11-202ENST00000498438 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 SASH1O94885 1247 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD11-202ENST00000498438 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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