RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 COA1Q9GZY4 146 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-205ENST00000496887 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-205ENST00000496887 H7C1D1 291 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-205ENST00000496887 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-205ENST00000496887 HTRA3P83110 453 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC24Q50LG9 513 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-205ENST00000496887 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 USP17L3A6NCW0 530 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 USP17L4A6NCW7 530 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 CNTROBQ8N137 903 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 GNAI3P08754 354 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 PASKQ96RG2 1323 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXW7Q969H0 707 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 UBE4AQ14139 1066 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 METTL24Q5JXM2 366 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 CD209Q9NNX6 404 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF609O15014 1411 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 DACT2Q5SW24 774 aa21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 GMLQ99445 158 aa21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 MXD3Q9BW11 206 aa21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 EGFRP00533 1210 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 EYA2O00167 538 aa21.08■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 PDE8BO95263 885 aa21.08■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 GTF2IP78347 998 aa21.08■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.08■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.08■□□□□ 0.97
KCNQ1-205ENST00000496887 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 USP17L8P0C7I0 530 aa21.07■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 RLBP1P12271 317 aa21.07■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 IL1R1P14778 569 aa21.07■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 SIL1Q9H173 461 aa21.07■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.07■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 GNAI2P04899 355 aa21.06■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 GYG1P46976 350 aa21.06■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.06■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.06■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.05■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.05■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 CREBZFQ9NS37 354 aa21.05■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAF5O00463 557 aa21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 SRGAP3O43295 1099 aa21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 CIAO1O76071 339 aa21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 MTX1Q13505 466 aa21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXO3Q9UK99 471 aa21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.03■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 COPRSQ9NQ92 184 aa21.03■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 FGFR2P21802 821 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 OGFOD1Q8N543 542 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 PANK1Q8TE04 598 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 KLRG1Q96E93 195 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 JAG2Q9Y219 1238 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-205ENST00000496887 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 SASH1O94885 1247 aa21.01■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 SCARF1Q14162 830 aa21.01■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.01■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 USP48Q86UV5 1035 aa21.01■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 VPS37DQ86XT2 251 aa21.01■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CERS5Q8N5B7 392 aa21.01■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 LPIN2Q92539 896 aa21■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP126Q9P2H0 1117 aa21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms