RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495280.5

PRRX1-205, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRX1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-205ENST00000495280 NAGPAQ9UK23 515 aa7.06□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 CUX2O14529 1486 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 GHRHP01286 108 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 PMEPA1Q969W9 287 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 SPACA7Q96KW9 195 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 LILRB5O75023 590 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 DGKGP49619 791 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 FAM129BQ96TA1 746 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 RBSNQ9H1K0 784 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 CHRDQ9H2X0 955 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 CUX1P39880 1505 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 TOPBP1Q92547 1522 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 ABCC8Q09428 1581 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 EREGO14944 169 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 NEFLP07196 543 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 TMC7Q7Z402 723 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 PLD4Q96BZ4 506 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-205ENST00000495280 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 PLCB3Q01970 1234 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ORC1Q13415 861 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 CEP120Q8N960 986 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 GNB5O14775 395 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 GPR182O15218 404 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 KIF4AO95239 1232 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 IGHA2P01877 340 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ATP11AP98196 1134 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 CEP135Q66GS9 1140 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 CD163Q86VB7 1156 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 PLVAPQ9BX97 442 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 PIK3R2O00459 728 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 TRPA1O75762 1119 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 LCE1DQ5T752 114 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 TTC9Q92623 222 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 TRIM11Q96F44 468 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 RASSF4Q9H2L5 321 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 SYNJ1O43426 1573 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 NID1P14543 1247 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ACPPP15309 386 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 GRIK5Q16478 980 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 PBX4Q9BYU1 374 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 EDN3P14138 238 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 DSC3Q14574 896 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ARTNQ5T4W7 220 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ASB16Q96NS5 453 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 CSRNP1Q96S65 589 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 OSMRQ99650 979 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 SOGA1O94964 1423 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 TREHO43280 583 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 MSL1Q68DK7 614 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 TOP2BQ02880 1626 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 IFT140Q96RY7 1462 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-205ENST00000495280 NFKBIEO00221 500 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRX1-205ENST00000495280 CHRNA4P43681 627 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms