RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		29.35	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	KIF16B	Q96L93	1317 aa		29.35	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		29.34	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		29.34	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		29.34	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	KCNJ4	P48050	445 aa		29.33	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		29.33	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		29.33	■■■□□ 2.29
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		29.32	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		29.32	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	RASSF10	A6NK89	507 aa		29.31	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	DACT2	Q5SW24	774 aa		29.31	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	29.3	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	TAF5L	O75529	589 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L8	P0C7I0	530 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	KLRK1	P26718	216 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	PCNT	O95613	3336 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	EGFR	P00533	1210 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	UBE4A	Q14139	1066 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	CD209	Q9NNX6	404 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	CST9	Q5W186	159 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
SERBP1-208	ENST00000493607	TRAF5	O00463	557 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	IL1R1	P14778	569 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	29.24	■■■□□ 2.27	8e-26	■□□□□ 9.1
SERBP1-208	ENST00000493607	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	SNAP23	O00161	211 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	OGFOD1	Q8N543	542 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	FBXO3	Q9UK99	471 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SERBP1-208	ENST00000493607	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	VEGFB	P49765	207 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	GTF2I	P78347	998 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	USP48	Q86UV5	1035 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	PLIN1	O60240	522 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	SCARF1	Q14162	830 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	GGA3	Q9NZ52	723 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	PDE8B	O95263	885 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	LRRC24	Q50LG9	513 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	SULF1	Q8IWU6	871 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	SASH1	O94885	1247 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	ECE1	P42892	770 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	FBXW7	Q969H0	707 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	MXD3	Q9BW11	206 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	TRIM27	P14373	513 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	METTL24	Q5JXM2	366 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	EYA2	O00167	538 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	BCAR3	O75815	825 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	GNAI3	P08754	354 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
SERBP1-208	ENST00000493607	WNT10B	O00744	389 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	CIAO1	O76071	339 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	MEIS3	Q99687	375 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SERBP1-208	ENST00000493607	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25

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