RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 UPP2O95045 317 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 TEAD4Q15561 434 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6ZNB5 142 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 AKAP12Q02952 1782 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 EML1O00423 815 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 SCNN1AP37088 669 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 MORC1Q86VD1 984 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 RNF217Q8TC41 542 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 POLKQ9UBT6 870 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 AXIN1O15169 862 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 BMP2P12643 396 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 BMP1P13497 986 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 TBCELQ5QJ74 424 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 AAASQ9NRG9 546 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 NSD2O96028 1365 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 PIK3C2AO00443 1686 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 MTHFSP49914 203 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 USP19O94966 1318 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SBNO1A3KN83 1393 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SCARF1Q14162 830 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 NLRP13Q86W25 1043 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SERTM1A2A2V5 107 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 NOS2P35228 1153 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SERPINB4P48594 390 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 C4orf17Q53FE4 359 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 WDR44Q5JSH3 913 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ABTB2Q8N961 1025 aa8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-212ENST00000491266 COG3Q96JB2 828 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ZFP42Q96MM3 310 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 MRS2Q9HD23 443 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SEPT3Q9UH03 358 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ITSN1Q15811 1721 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 INSRP06213 1382 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 NFAT5O94916 1531 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 TTLL8A6PVC2 850 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ST8SIA5O15466 376 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 PIP4K2BP78356 416 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 MTMR7Q9Y216 660 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 KIF1AQ12756 1690 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ALS2Q96Q42 1657 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SLIT3O75094 1523 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 PEAK1Q9H792 1746 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 GCP02774 474 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 GNASQ5JWF2 1037 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 DACH1Q9UI36 760 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 IL13P35225 146 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.23□□□□□ -1.09
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