RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PLD4Q96BZ4 506 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 EHD4Q9H223 541 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 UNCXA6NJT0 531 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 NFKBIEO00221 500 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHA1P01876 353 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 AMPD1P23109 780 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 GNA15P30679 374 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM25P49756 843 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 FGD1P98174 961 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 GRM2Q14416 872 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP135Q66GS9 1140 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 BTBD6Q96KE9 485 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 PBX4Q9BYU1 374 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 RBSNQ9H1K0 784 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL12A8MUP2 240 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 DAB2P98082 770 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K10Q02779 954 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMD2Q13200 908 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 TCF12Q99081 682 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 BCO2Q9BYV7 579 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 SPG7Q9UQ90 795 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R082 166 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.521e-14■■■■□ 25.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TMC4Q7Z404 712 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 CCNJLQ8IV13 435 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 NXPE3Q969Y0 559 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf49Q9H741 205 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC4BQ9NT99 713 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIA4P48058 902 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIK5Q16478 980 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 NEDD1Q8NHV4 660 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 MRS2Q9HD23 443 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCB6Q9NP58 842 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 SORBS3O60504 671 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 LILRB5O75023 590 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 FCGRTP55899 365 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC9Q92623 222 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 FRMD6Q96NE9 622 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 RRAGCQ9HB90 399 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 AK5Q9Y6K8 562 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A096LPE4 126 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PPZ6 126 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 GIPC1O14908 333 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 USP17L7P0C7H9 530 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPRAP18433 802 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 DGKGP49619 791 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 MUC3BQ9H195 1237 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGB2P05107 769 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSHP09668 335 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC25BP30305 580 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 BAG6P46379 1132 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 BSNDQ8WZ55 320 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM19Q9H013 955 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.51□□□□□ -1.53
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