RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484846.1

EHD1-209, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 3,469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-209ENST00000484846 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.47■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.47■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 FAM182BQ5T319 152 aa15.47■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.47■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 CYP21A2P08686 494 aa15.47■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 PGBD1Q96JS3 809 aa15.47■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 KINO60870 393 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 TNNI3KQ59H18 835 aa15.46■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.46■□□□□ 0.07
EHD1-209ENST00000484846 AFF2P51816 1311 aa15.46■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 HOXB7P09629 217 aa15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 GPTP24298 496 aa15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SCRN1Q12765 414 aa15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 MTX1Q13505 466 aa15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 TMEM51Q9NW97 253 aa15.44■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 PTPDC1A2A3K4 754 aa15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 FSIP1Q8NA03 581 aa15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 A0A1B0GVL5 298 aa15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 GTF3C6Q969F1 213 aa15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CFAP45Q9UL16 551 aa15.43■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SMC2O95347 1197 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 ATP2B3Q16720 1220 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CERS3Q8IU89 383 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 ZNF75DP51815 510 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 KRT32Q14532 448 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 USP28Q96RU2 1077 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 APPP05067 770 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.42■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CPLX1O14810 134 aa15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 RXRAP19793 462 aa15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 PTPN21Q16825 1174 aa15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 PDIA6Q15084 440 aa15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 STK38Q15208 465 aa15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 TPM3P06753 285 aa15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 ZBTB9Q96C00 473 aa15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 USP54Q70EL1 1684 aa15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 SKILP12757 684 aa15.4■□□□□ 0.06
EHD1-209ENST00000484846 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 LRRC24Q50LG9 513 aa15.39■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 PAG1Q9NWQ8 432 aa15.39■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.39■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 USP27XA6NNY8 438 aa15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 FAM89AQ96GI7 184 aa15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 ATP5JP18859 108 aa15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 VPS72Q15906 364 aa15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.38■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 ATP2B1P20020 1258 aa15.37■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 RESTQ13127 1097 aa15.37■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 PI16Q6UXB8 463 aa15.37■□□□□ 0.05
EHD1-209ENST00000484846 TOMM22Q9NS69 142 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms