RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	COA1	Q9GZY4	146 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	RASSF10	A6NK89	507 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	MXD3	Q9BW11	206 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	KCNJ4	P48050	445 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	VEGFB	P49765	207 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	DLK2	Q6UY11	383 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	USP44	Q9H0E7	712 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	DACT2	Q5SW24	774 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	USP48	Q86UV5	1035 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PSME4-208	ENST00000481518	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L8	P0C7I0	530 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	FBXW7	Q969H0	707 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	PLIN1	O60240	522 aa		29	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	ADM5	C9JUS6	153 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	CD209	Q9NNX6	404 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	GGA3	Q9NZ52	723 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	PCNT	O95613	3336 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	GTF2I	P78347	998 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		28.95	■■■□□ 2.23
PSME4-208	ENST00000481518	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.95	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	SCARF1	Q14162	830 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	LRRC24	Q50LG9	513 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	CAPNS2	Q96L46	248 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	IL1R1	P14778	569 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	SULF1	Q8IWU6	871 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	CERS5	Q8N5B7	392 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	KIF16B	Q96L93	1317 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	UBE4A	Q14139	1066 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	OGFOD1	Q8N543	542 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	GRM1	Q13255	1194 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	JAG2	Q9Y219	1238 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PSME4-208	ENST00000481518	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	GYG1	P46976	350 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	WNT10B	O00744	389 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	FOXN1	O15353	648 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	BCAR3	O75815	825 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	SASH1	O94885	1247 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	ECE1	P42892	770 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	CDCA5	Q96FF9	252 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	TNN	Q9UQP3	1299 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	METTL24	Q5JXM2	366 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	MEIS3	Q99687	375 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	WBP1L	Q9NX94	342 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	AOC2	O75106	756 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	PDE8B	O95263	885 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PSME4-208	ENST00000481518	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21

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