RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	ATP2B3	Q16720	1220 aa		30.1	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	NIM1K	Q8IY84	436 aa		30.1	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	30.1	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		30.1	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC5A1	P13866	664 aa		30.09	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	30.09	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	COL4A5	P29400	1685 aa		30.08	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		30.08	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		30.08	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	COA1	Q9GZY4	146 aa		30.08	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		30.08	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	CHD4	Q14839	1912 aa		30.07	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	FZD9	O00144	591 aa		30.07	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	DOK7	Q18PE1	504 aa		30.07	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414		G3V3G9	751 aa		30.06	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	TIMM10	P62072	90 aa		30.06	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		30.06	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		30.06	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A1B0GUL7	405 aa		30.05	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		30.05	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	PODN	Q7Z5L7	613 aa		30.05	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		30.05	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	ECE2	O60344	883 aa		30.04	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	30.04	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	TNNI3K	Q59H18	835 aa		30.04	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		30.04	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		30.04	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	GYG1	P46976	350 aa		30.03	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	GCC1	Q96CN9	775 aa		30.03	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	CD209	Q9NNX6	404 aa		30.03	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF609	O15014	1411 aa		30.03	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	YDJC	A8MPS7	323 aa		30.02	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	APBB1	O00213	710 aa		30.02	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	IGHD	P01880	384 aa		30.02	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		30.02	■■■□□ 2.4
KCNS3-205	ENST00000481414	IL1R1	P14778	569 aa		30.01	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	30.01	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	XAGE2	Q96GT9	111 aa		30.01	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		30.01	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	ADORA1	P30542	326 aa		30	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	BCAM	P50895	628 aa		30	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	VPS37D	Q86XT2	251 aa		30	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	30	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		30	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	CXCL9	Q07325	125 aa		29.99	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	29.99	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		29.98	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	SMC5	Q8IY18	1101 aa		29.98	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		29.98	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	ZBTB22	O15209	634 aa		29.97	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		29.97	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		29.97	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		29.96	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	TNIP1	Q15025	636 aa		29.96	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC102B	Q68D86	513 aa		29.96	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		29.96	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	AACS	Q86V21	672 aa		29.96	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	GLTPD2	A6NH11	291 aa		29.95	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	RAD17	O75943	681 aa		29.95	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		29.95	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
KCNS3-205	ENST00000481414	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		29.95	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	USP17L3	A6NCW0	530 aa		29.94	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	USP17L4	A6NCW7	530 aa		29.94	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	PHKA1	P46020	1223 aa		29.94	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	GORAB	Q5T7V8	394 aa		29.94	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		29.94	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	GPC2	Q8N158	579 aa		29.94	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		29.93	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	PSMD14	O00487	310 aa		29.92	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		29.92	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		29.92	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	SCN9A	Q15858	1988 aa		29.92	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	SEMA3E	O15041	775 aa		29.91	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		29.91	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		29.91	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	GTF2I	P78347	998 aa		29.9	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		29.9	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	YY1	P25490	414 aa		29.89	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	DACT2	Q5SW24	774 aa		29.89	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.38
KCNS3-205	ENST00000481414	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		29.88	■■■□□ 2.37
KCNS3-205	ENST00000481414	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
KCNS3-205	ENST00000481414	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		29.88	■■■□□ 2.37
KCNS3-205	ENST00000481414	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		29.88	■■■□□ 2.37
KCNS3-205	ENST00000481414	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms